シノビオリン

SYVN1
識別子
記号	SYVN1, DER3, HRD1, synoviolin 1
外部ID	OMIM: 608046 MGI: 1921376 HomoloGene: 32700 GeneCards: SYVN1
遺伝子の位置 (ヒト)
染色体	11番染色体 (ヒト)
終点	65,134,532 bp
遺伝子の位置 (マウス)
染色体	19番染色体 (マウス)
終点	6,103,742 bp
遺伝子オントロジー
分子機能	• シャペロン結合; • unfolded protein binding; • ATPase binding; • 金属イオン結合; • 血漿タンパク結合; • ubiquitin-specific protease binding; • ubiquitin protein ligase activity; • トランスフェラーゼ活性;
細胞の構成要素	• integral component of membrane; • endoplasmic reticulum membrane; • 核質; • smooth endoplasmic reticulum; • integral component of endoplasmic reticulum membrane; • endoplasmic reticulum quality control compartment; • Derlin-1 retrotranslocation complex; • Hrd1p ubiquitin ligase complex; • Hrd1p ubiquitin ligase ERAD-L complex; • 膜; • 小胞体;
生物学的プロセス	• タンパク質の安定化; • protein K48-linked ubiquitination; • retrograde protein transport, ER to cytosol; • IRE1-mediated unfolded protein response; • negative regulation of endoplasmic reticulum stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway; • protein N-linked glycosylation via asparagine; • endoplasmic reticulum mannose trimming; • 小胞体関連分解; • 小胞体ストレス; • ubiquitin-dependent ERAD pathway; • protein ubiquitination; • ubiquitin-dependent protein catabolic process;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	84447
	74126
	ENSG00000162298
	ENSMUSG00000024807
	Q86TM6,E9PK19
	Q9DBY1
	NM_032431; NM_172230
	NM_001164709; NM_028769
	NP_115807; NP_757385
	NP_001158181; NP_083045
	ウィキデータ
閲覧/編集ヒト	閲覧/編集マウス

シノビオリン（Synoviolin）はSYVN1遺伝子にコードされるE3ユビキチンリガーゼである^[5]^[6]。SYVN1が発現している組織である滑膜細胞（synovial cell）にちなんでシノビオリンと名づけられた^[7]。リウマチの原因遺伝子の一つとして知られる^[8]。HRD1(HMG-CoA Reductase Degradation 1 Homolog)とも呼ばれる^[9]。

機能編集

シノビオリンは小胞体関連分解に関わるタンパク質である。シノビオリンは、小胞体ストレスによって発現が誘導され、小胞体ストレスの原因となる変性タンパク質を、小胞体から細胞質へと逆行性輸送することで除去する^[10]。SEL1L（英語版）との複合体であるSEL1L-HRD1複合体は哺乳類で最もよく保存されている小胞体関連分解機構である^[11]。シノビオリンはまたユビキチン-プロテアソームシステムによる変性タンパク質分解も行う^[9]。シノビオリンノックアウトマウスは胚性致死であることから、胚発生に必須であると考えられている^[12]。

脚注編集

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^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000162298 - Ensembl, May 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000024807 - Ensembl, May 2017
^ Human PubMed Reference:
^ Mouse PubMed Reference:
^ “Synoviolin/Hrd1, an E3 ubiquitin ligase, as a novel pathogenic factor for arthropathy”. Genes & Development 17 (19): 2436–49. (October 2003). doi:10.1101/gad.1096603. PMC 218080. PMID 12975321.
^ “Entrez Gene: SYVN1 synovial apoptosis inhibitor 1, synoviolin”. 2019年7月22日閲覧。
^ 公開特許公報
^ リウマチ発症に関与するシノビオリン遺伝子をノックアウトしたマウスで体重と脂肪の顕著な減少を確認
^ ^a ^b Harder, Bryan; Jiang, Tao; Wu, Tongde; Tao, Shasha; de la Vega, Montserrat Rojo; Tian, Wang; Chapman, Eli; Zhang, Donna D. (2015-08-01). “Molecular mechanisms of Nrf2 regulation and how these influence chemical modulation for disease intervention”. Biochemical Society Transactions 43 (4): 680–686. doi:10.1042/BST20150020. ISSN 0300-5127. PMC 4613518. PMID 26551712.
^ 金子, 雅幸「小胞体に関連するユビキチンリガーゼの生理機能」『YAKUGAKU ZASSHI』第136巻第6号、日本薬学会、2016年6月1日、805–809頁、doi:10.1248/yakushi.15-00292-2、ISSN 0031-6903。
^ Hwang, Jiwon; Qi, Ling (2018-8). “Quality Control in the Endoplasmic Reticulum: Crosstalk between ERAD and UPR pathways”. Trends in biochemical sciences 43 (8): 593–605. doi:10.1016/j.tibs.2018.06.005. ISSN 0968-0004. PMC 6327314. PMID 30056836.
^ Yagishita, Naoko; Ohneda, Kinuko; Amano, Tetsuya; Yamasaki, Satoshi; Sugiura, Akiko; Tsuchimochi, Kaneyuki; Shin, Hiroshi; Kawahara, Ko-ichi et al. (2005-03-04). “Essential Role of Synoviolin in Embryogenesis” (英語). Journal of Biological Chemistry 280 (9): 7909–7916. doi:10.1074/jbc.M410863200. ISSN 0021-9258.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000162298 - Ensembl, May 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000024807 - Ensembl, May 2017

[3] Human PubMed Reference:

[4] Mouse PubMed Reference:

[pmid12975321-5] “Synoviolin/Hrd1, an E3 ubiquitin ligase, as a novel pathogenic factor for arthropathy”. Genes & Development 17 (19): 2436–49. (October 2003). doi:10.1101/gad.1096603. PMC 218080. PMID 12975321.

[entrez-6] “Entrez Gene: SYVN1 synovial apoptosis inhibitor 1, synoviolin”. 2019年7月22日閲覧。

[Tamra41-1-7] 公開特許公報

[Take14-8] リウマチ発症に関与するシノビオリン遺伝子をノックアウトしたマウスで体重と脂肪の顕著な減少を確認

[Harder2015-9] Harder, Bryan; Jiang, Tao; Wu, Tongde; Tao, Shasha; de la Vega, Montserrat Rojo; Tian, Wang; Chapman, Eli; Zhang, Donna D. (2015-08-01). “Molecular mechanisms of Nrf2 regulation and how these influence chemical modulation for disease intervention”. Biochemical Society Transactions 43 (4): 680–686. doi:10.1042/BST20150020. ISSN 0300-5127. PMC 4613518. PMID 26551712.

[10] 金子, 雅幸「小胞体に関連するユビキチンリガーゼの生理機能」『YAKUGAKU ZASSHI』第136巻第6号、日本薬学会、2016年6月1日、805–809頁、doi:10.1248/yakushi.15-00292-2、ISSN 0031-6903。

[11] Hwang, Jiwon; Qi, Ling (2018-8). “Quality Control in the Endoplasmic Reticulum: Crosstalk between ERAD and UPR pathways”. Trends in biochemical sciences 43 (8): 593–605. doi:10.1016/j.tibs.2018.06.005. ISSN 0968-0004. PMC 6327314. PMID 30056836.

[12] Yagishita, Naoko; Ohneda, Kinuko; Amano, Tetsuya; Yamasaki, Satoshi; Sugiura, Akiko; Tsuchimochi, Kaneyuki; Shin, Hiroshi; Kawahara, Ko-ichi et al. (2005-03-04). “Essential Role of Synoviolin in Embryogenesis” (英語). Journal of Biological Chemistry 280 (9): 7909–7916. doi:10.1074/jbc.M410863200. ISSN 0021-9258.

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シノビオリン

機能 編集

脚注 編集

機能編集

脚注編集