ダン・トゥフィック

進化生物学研究者

ダン・サラー・トゥフィック(Dan Salah Tawfik, 1955年5月28日2021年5月4日)はイスラエル生化学者タンパク質工学進化生化学、特に酵素進化における貢献で有名。[1] [2]

Dan Tawfik
ダン・トゥフィック
生誕 Dan Salah Tawfik
(1955-05-28) 1955年5月28日
イスラエルの旗 イスラエル, エルサレム
死没 2021年5月4日(2021-05-04)(65歳)
クロアチアの旗 クロアチア, パクレニツァ
国籍 イスラエルの旗 イスラエル
研究分野
研究機関 ワイツマン科学研究所
出身校 ヘブライ大学
ワイツマン科学研究所
博士課程
指導教員
Profs. Zelig Eshhar and Michael Sela
主な業績
主な受賞歴
  • Teva Award for Excellence in Memory of Eli Hurvitz (2013)
  • The ECI Enzyme Engineering Award (2015)
  • EMET Prize in Life Sciences (2020)
プロジェクト:人物伝
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来歴 編集

イラクからのユダヤ人移民の家族にエルサレムで生まれた。[3] エルサレムのヘブライ大学で化学と生化学の理学士号(1988年)、バイオテクノロジーの修士号(1990年)を取得。ワイツマン科学研究所で博士号を取得(1995年)。[4]その後英国に移り、ケンブリッジ大学およびイギリス医学研究審議会タンパク質工学センター(Centre for Protein Engineering)でアラン・ファーシュト(Alan Fersht)の下で2年間のポスドク研究後、ケンブリッジ大学シドニー・サセックス・カレッジ(Sidney Sussex College)およびタンパク質工学センターで上級研究員[4]に、1999年にグループリーダーに任命された。2001年にワイツマン科学研究所の生物化学科(現在の生体分子科学科)に加わり、2010年からネラとレオンベノジヨ生化学(the Nella and Leon Benoziyo Professorial Chair of Biochemistry)の議長を務めた。また、2019年から亡くなる時までワイツマン科学研究所科学評議会の副議長を務めた。[1][5]]

2021年5月4日、クロアチアのパクレニツァ国立公園のアニチャククでのロッククライミング事故で亡くなった。[1][6][7]

研究 編集

IVC法(in vitro compartmentalization)をアンドリュー・グリフィスと共同で開発した。[8][9]この技術により、エマルジョン液滴内の単一DNA / RNA分子の区画化が可能になり、遺伝子を複製、転写、翻訳できる細胞のような区画が提供される。 この技術により、生細胞を用いることなく酵素の進化を指示することが可能になり、454 lifescience社のシーケンス技術やSOLiD技術(Sequence by Oligo Ligation and Detection)などの超並列シーケンス技術(massive parallel sequencing methods)[10]デジタルポリメラーゼ連鎖反応(デジタルPCR)の基礎にもなった。

enzyme promiscuityと、酵素進化におけるその役割の研究で、トゥフィックは最も早期かつ最も引用された貢献者の1人であった。[11] タンパク質構造多様性とそのpromiscuityの関連を示し[12]、promiscuousタンパク質機能(タンパク質の元の機能のわずかな影響でpromiscuous活動を劇的に強化する突然変異の能力)の進化の可能性[13]や農薬分解酵素の進化におけるpromiscuityの役割を示した。[14]彼のグループはまた、新しい酵素につながる進化の軌跡、およびタンパク質の折り畳みと安定性、進化可能性の関連にも取り組んでいた。[15]

最初の酵素の出現に関する彼の研究は、最も一般的な酵素系統であるロスマンフォールド酵素とPループNTPアーゼの祖先を単純なポリペプチドで確立することに取り組み、[16] [17]最初のカチオン性アミノ酸としてオルニチンを示唆した。[17]そしてpromiscuousタンパク質機能の進化可能性(タンパク質の元の機能のわずかな影響でpromiscuous activityを劇的に強化する突然変異の能力)を示した。[18]

受賞歴 編集

  • The Wolgin Prize for Scientific Excellence (2007)
  • The Weizmann Prize from the Tel Aviv municipality (2007)
  • EMBO member (2009)[19][20]
  • Teva Award for Excellence in Memory of Eli Hurvitz (2013)[21]
  • The ECI Enzyme Engineering Award (2015)
  • The EMET Prize in Life Sciences (2020)[22]

脚注 編集

  1. ^ a b c Atzmon, Yahel (2021年5月6日). “נפטר, פרופ' דן תופיק, החוקר שהבין חלבונים” [Deceased, Prof. Dan Tawfiq, the researcher who understood proteins] (ヘブライ語). ynet.co.il. 2021年8月2日閲覧。
  2. ^ Elias, Mikael H; Fraser, James S; Kamerlin, Shina Caroline Lynn; Patrick, Wayne M; Jackson, Colin J (2021-05-27). “Dan Salah Tawfik (1955‐2021)—A giant of protein evolution”. EMBO Reports: e53256. doi:10.15252/embr.202153256. PMID 34046990. 
  3. ^ פרס א.מ.ת. | פרס האמנות, המדע והתרבות”. emetprize.com. 2021年5月5日閲覧。
  4. ^ a b 2017 Speaker bios: Tawfik, Dan”. www.ch.cam.ac.uk (2017年9月5日). 2021年5月11日閲覧。
  5. ^ Scientific Council Chair and Vice Chair” (英語). Academic Affairs Office (2015年10月18日). 2021年5月11日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年5月11日閲覧。
  6. ^ World-famous Israeli biologist dies in climbing accident in Croatia.” (英語). The Jerusalem Post (2021年5月6日). 2021年5月11日閲覧。
  7. ^ Jutarnji list - Tragedija u Nacionalnom parku Paklenica: S Anića kuka pao muškarac i na mjestu poginuo” (クロアチア語). www.jutarnji.hr (2021年5月4日). 2021年5月8日閲覧。
  8. ^ Laboratoire de Biochimie : Team”. www.lbc.espci.fr. 2021年8月2日閲覧。
  9. ^ Tawfik, D.S.; Griffiths, A.D. (1998). “Man-made cell-like compartments for molecular evolution”. Nat. Biotech. 16 (7): 652–6. doi:10.1099/00221287-101-1-1. PMID 9661199. 
  10. ^ Griffiths, Andrew D.; Tawfik, Dan S. (November 2006). “Miniaturising the laboratory in emulsion droplets”. Trends in Biotechnology 24 (9): 395–402. doi:10.1016/j.tibtech.2006.06.009. ISSN 0167-7799. PMID 16843558. https://doi.org/10.1016/j.tibtech.2006.06.009. 
  11. ^ Dan S Tawfik”. scholar.google.com. 2021年5月8日閲覧。
  12. ^ James, L.C.; Tawfik, D.S. (2003). “Conformational diversity and protein evolution--a 60-year-old hypothesis revisited”. Trends Biochem. Sci. 28 (7): 361–8. doi:10.1038/ng1482. PMID 15568024. 
  13. ^ Aharoni, A.; Gaidukov, L.; Khersonsky, O.; McQ Gould, S.; Roodveldt, C.; Tawfik, D.S. (2005). “The 'evolvability' of promiscuous protein functions”. Nature Genetics 37 (7): 73–76. doi:10.1016/S0968-0004(03)00135-X. PMID 12878003. 
  14. ^ Afriat, L.; Roodveldt, C.; Manco, G.; Tawfik, D.S. (2006). “The latent promiscuity of newly identified microbial lactonases is linked to a recently diverged phosphotriesterase”. Biochemistry 45 (46): 3677–86. doi:10.1021/bi061268r. PMID 17105187. 
  15. ^ Tokuriki, N.; Tawfik, D.S. (2009). “Stability effects of mutations and protein evolvability”. Curr. Opin. Struct. Biol. 19 (5): 596–604. doi:10.1016/j.sbi.2009.08.003. PMID 19765975. 
  16. ^ Longo, L.M.; Jablonska, J.; Vyas, P.; Kanade, M.; Kolodny, R.; Ben-Tal, N.; Tawfik, D.S. (2020). “On the emergence of P-Loop NTPase and Rossmann enzymes from a Beta-Alpha-Beta ancestral fragment”. eLife 9. doi:10.7554/eLife.64415. PMC 7758060. PMID 33295875. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7758060/. 
  17. ^ a b Romero Romero, M.L.; Yang, F.; Lin, Y-R.; Toth-Petroczy, A.; Berezovky, I.N.; Goncearenco, A.; Yang, W.; Wellner, A. et al. (2018). “Simple yet functional phosphate-loop proteins”. Proc Natl Acad Sci USA 115 (51): E11943–E11950. doi:10.1073/pnas.1812400115. PMC 6304952. PMID 30504143. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6304952/. 
  18. ^ Longo, L.M.; Despotovic, D.; Weil-Ktorza, O.; Walker, M.J.; Jablonska, J.; Fridmann-Sirkis, Y.; Varani, G.; Metanis, N. et al. (2020). “Primordial emergence of a nucleic acid-binding protein via phase separation and statistical ornithine-to-arginine conversion”. Proc Natl Acad Sci USA 117 (27): 15731–15739. doi:10.1073/pnas.2001989117. PMC 7355028. PMID 32561643. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7355028/. 
  19. ^ Awards and appointments: Tawfik EMBO”. wis-wander.weizmann.ac.il. Weizmann Institute (2010年10月5日). 2021年8月2日閲覧。
  20. ^ Find people in the EMBO Communities”. people.embo.org. 2021年8月2日閲覧。
  21. ^ Awards and appointments: Tawfik Teva”. wis-wander.weizmann.ac.il. Weizmann Institute (2013年8月7日). 2021年8月2日閲覧。
  22. ^ פרס א.מ.ת. | פרס האמנות, המדע והתרבות”. emetprize.com. 2021年8月2日閲覧。