ハプログループE (mtDNA)
ハプログループE (mtDNA)（ハプログループE (ミトコンドリアDNA)、英: Haplogroup E (mtDNA)）とは、分子人類学で用いられる、人類のミトコンドリアDNAハプログループ（型集団）の分類のうち、「M9」を祖先に持ち、3027, 3705, 7598, 13626, 16390の変異により定義されるものである。
| ハプログループ E | |
|---|---|
| 発生時期 | 35,000[1] -8,000[2] 年前 |
| 推定発生地 | 福建省沿岸部[2] |
| 親系統 | M9 |
| 子系統 | E1, E2 |
| 定義づけられる変異 | 3027, 3705, 7598, 13626, 16390[3] |
分布 編集
ハプログループEは海域東南アジアにおいて広く見られる[4]。姉妹群のM9a（日本でも見られる）が分布する[4][5]東アジア大陸部にはほとんど見られない。特にオーストロネシア語族話者によく見られ、他の語族の話者には稀である。台湾、フィリピン、インドネシア、マレーシア、パプアニューギニア沿岸部、太平洋諸島の特にチャモロ人でみられる[4][6][7][8][9][10]。
下位系統のうち、E1bとE2aは海域東南アジアでみられ、E1aとE2bは台湾で見られる[1]。
起源 編集
かつてはスンダランド起源説[1]も唱えられていたが、2014年、中国南東部の亮島で発見された8,000年前の人骨がハプログループEに属していることが判明した。このことから、ハプログループEは11,000-8,000年前に福建省沿岸部で誕生し、新石器時代の6,000年前に台湾に入り、オーストロネシア語族の拡散と共に台湾から東南アジアの島々に広がっていったと推定されている[2]。
| ミトコンドリア・イブ (L) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| L0 | L1 | L5 | L2 | L6 | L4 | L3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| M | N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| M7 | M8 | M9 | D | G | Q | N1 | N2 | N9 | A | O | S | X | R | ||||||||||||||||||||||||||
| M7a | C | Z | E | I | W | Y | R0 | R9 | B | JT | P | U | |||||||||||||||||||||||||||
| HV | F | J | T | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| H | V | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
脚注 編集
- ^ a b c Soares, Pedro; Trejaut, Jean Alain; Loo, Jun-Hun; Hill, Catherine; Mormina, Maru; Lee, Chien-Liang; Chen, Yao-Ming; Hudjashov, Georgi; Forster, Peter; Macaulay, Vincent; Bulbeck, David; Oppenheimer, Stephen; Lin, Marie; Richards, Martin B. (2008). "Climate Change and Postglacial Human Dispersals in Southeast Asia". Molecular Biology and Evolution. 25 (6): 1209–1218. doi:10.1093/molbev/msn068. PMID 18359946.
- ^ a b c Ko, Albert Min-Shan; Chen, Chung-Yu; Fu, Qiaomei; Delfin, Frederick; Li, Mingkun; Chiu, Hung-Lin; Stoneking, Mark; Ko, Ying-Chin (2014). "Early Austronesians: into and out of Taiwan". The American Journal of Human Genetics. 94 (3): 426–436. doi:10.1016/j.ajhg.2014.02.003. PMC 3951936. PMID 24607387.
- ^ van Oven, Mannis; Kayser, Manfred (2008). "Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation". Human Mutation. 30 (2): E386–E394. doi:10.1002/humu.20921. PMID 18853457. S2CID 27566749. Archived from the original on 4 December 2012. Retrieved 2009-05-20.
- ^ a b c Hill, Catherine; Soares, Pedro; Mormina, Maru; Macaulay, Vincent; Clarke, Dougie; Blumbach, Petya B.; Vizuete-Forster, Matthieu; Forster, Peter; Bulbeck, David; Oppenheimer, Stephen; Richards, Martin (2007). "A Mitochondrial Stratigraphy for Island Southeast Asia". American Journal of Human Genetics. 80 (1): 29–43. doi:10.1086/510412. PMC 1876738. PMID 17160892.
- ^ Trejaut, Jean A.; Kivisild, Toomas; Loo, Jun Hun; Lee, Chien Liang; He, Chun Lin; Hsu, Chia Jung; Lee, Zheng Yuan; Lin, Marie (2005). "Traces of Archaic Mitochondrial Lineages Persist in Austronesian-Speaking Formosan Populations". PLOS Biology. 3 (8). e247. doi:10.1371/journal.pbio.0030247. PMC 1166350. PMID 15984912.
- ^ Tabbada, Kristina A.; Trejaut, Jean; Loo, Jun-Hun; Chen, Yao-Ming; Lin, Marie; Mirazón-Lahr, Marta; Kivisild, Toomas; De Ungria, Maria Corazon A. (2010). "Philippine Mitochondrial DNA Diversity: A Populated Viaduct between Taiwan and Indonesia?". Molecular Biology and Evolution. 27 (1): 21–31. doi:10.1093/molbev/msp215. PMID 19755666.
- ^ Peng, Min-Sheng; Quang, Huy Ho; Dang, Khoa Pham; Trieu, An Vu; Wang, Hua-Wei; Yao, Yong-Gang; Kong, Qing-Peng; Zhang, Ya-Ping (2010). "Tracing the Austronesian Footprint in Mainland Southeast Asia: A Perspective from Mitochondrial DNA". Molecular Biology and Evolution. 27 (10): 2417–2430. doi:10.1093/molbev/msq131. PMID 20513740.
- ^ Hill, Catherine; Soares, Pedro; Mormina, Maru; Macaulay, Vincent; Meehan, William; Blackburn, James; Clarke, Douglas; Raja, Joseph Maripa; Ismail, Patimah; Bulbeck, David; Oppenheimer, Stephen; Richards, Martin (2006). "Phylogeography and Ethnogenesis of Aboriginal Southeast Asians". Molecular Biology and Evolution. 23 (12): 2480–2491. doi:10.1093/molbev/msl124. PMID 16982817.
- ^ Vilar, Miguel G.; Chan, Chim W.; Santos, Dana R.; Lynch, Daniel; Spathis, Rita; Garruto, Ralph M.; Lum, J. Koji (2013). "The Origins and Genetic Distinctiveness of the Chamorros of the Marianas Islands: An mtDNA Perspective". American Journal of Human Biology. 25 (1): 116–122. doi:10.1002/ajhb.22349. PMC 4335639. PMID 23180676.
- ^ Peng, Min-Sheng; He, Jun-Dong; Liu, Hai-Xin; Zhang, Ya-Ping (2011). "Tracing the legacy of the early Hainan Islanders – a perspective from mitochondrial DNA". BMC Evolutionary Biology. 11 (46): 46. doi:10.1186/1471-2148-11-46. PMC 3048540. PMID 21324107.