イーディー＝ホフステー図

生化学において、イーディー＝ホフステー図（イーディー＝ホフステーず、英: Eadie–Hofstee diagram）は、反応速度を反応速度と基質濃度の比の関数としてプロットする酵素反応速度論のグラフ表現である。ウルフ＝イーディー＝アウグスティンソン＝ホフステープロット（Woolf–Eadie–Augustinsson–Hofstee plot）あるいはイーディー＝アウグスティンソンプロットとも呼ばれる。

$v=-K_{m}{v \over [S]}+V_{\max }$

上式において、 $v$ は反応速度、K_mはミカエリス・メンテン定数、[S] は基質濃度、 $V_{\max }$ は最大反応速度である。

これはミカエリス・メンテン式から以下のように導くことができる。

$v={{V_{\max }{}[S]} \over {K_{m}+[S]}}$

逆数を取り、 $V_{\max }$ を掛けると、

${V_{\max } \over v}={{V_{\max }{}(K_{m}+[S])} \over {V_{\max }{}[S]}}={{K_{m}+[S]} \over {[S]}}$

変形すると、

$V_{\max }={{{vK_{m}} \over {[S]}}+{{v[S]} \over {[S]}}}={{vK_{m}} \over {[S]}}+v$

$v$ を分離すると、

$v=-K_{m}{v \over {[S]}}+V_{\max }$

となる。

vをv/[S] に対してプロットすると、y切片としてV_max、x切片としてV_max/K_m、負の傾きとしてK_mが得られる。

ミカエリス・メンテン式を線型化するその他の手法と同様に、イーディー＝ホフステー図はK_mやV_maxのような重要な反応速度論的パラメータを迅速に決定するために歴史的に使用されていたが、はるかに正確である非線型回帰手法に取って代わられている。イーディー＝ホフステー図はラインウィーバー＝バークプロットよりも間違いが発生しやすいデータに対してより頑健である。これは、イーディー＝ホフステー図ではいかなる範囲の基質濃度あるいは反応速度におけるデータ点も同等に重視するためである（ラインウィーバー＝バークプロットはこのような点に対して不均等に重み付けをする）。どちらのプロットもデータをグラフを使って示す方法としては引き続き有用である。

イーディー＝ホフステー図の1つの欠点は、縦座標と横座標のどちらも独立変数を表わさない点である（どちらも反応速度に依存している）。そのため、全ての実験誤差がどちらの軸にも表われる。また、実験誤差あるいは不確かさが不均等に伝播し横座標の至るところでより大きくなり、それによってより小さなv/[S] の値により重視することになる。ゆえに、線型回帰の適合度の典型的な指標である相関係数Rを適用できない。

参考文献編集

Eadie, GS (1942). “The Inhibition of Cholinesterase by Physostigmine and Prostigmine”. Journal of Biological Chemistry 146: 85–93.
Hofstee, BHJ (1959). “Non-Inverted Versus Inverted Plots in Enzyme Kinetics”. Nature 184 (4695): 1296–1298. doi:10.1038/1841296b0. PMID 14402470.
Dowd, JE; Riggs, DS (1965). “A Comparison of Estimates of Michaelis–Menten Kinetic Constants from Various Linear Transformations”. Journal of Biological Chemistry 240: 863–869. PMID 14275146.
Atkins, GL; Nimmo, IA (1975). “A comparison of seven methods for fitting the Michaelis–Menten equation”. Biochemical Journal 149 (3): 775–777. PMC 1165686. PMID 1201002.

イーディー＝ホフステー図

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関連項目 編集

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