東京都の二級水系一覧
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東京都の二級水系一覧では、東京都を流れる水系のうち、東京都が管理する二級水系を記述する。2012年現在10水系、15河川ある。
リストの順序は東から西・島嶼部の順に、河口の位置を基準にして並んでいる。地形順の参考として一級水系（国土交通省管轄）も記載している。括弧内の水系名が一級水系。
| 水系名 | 延長(km) | 流域面積(km2) | 河川数 | 河口所在地 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| (利根川) | 77.12 | 10 | 銚子市、神栖市 | 一級水系 | |
| (荒川) | 253.036 | 38 | 江戸川区、江東区 | 一級水系 | |
| 越中島川 | 0.54 | 0.37 | 1 | 江東区 | |
| 築地川 | 0.75 | 5.55 | 1 | 中央区 | |
| 汐留川 | 0.90 | 0 | 1 | 中央区 | |
| 古川 | 7.0 | 22.84 | 2 | 港区 | [1] |
| 目黒川 | 30.13 | 45.8 | 4 | 品川区 | |
| 立会川 | 7.41 | 7.6 | 1 | 品川区 | |
| 内川 | 1.55 | 3.25 | 1 | 大田区 | |
| 呑川 | 17.03 | 2 | 大田区 | ||
| (多摩川) | 410.98 | 40 | 大田区 | 一級水系 | |
| (鶴見川) | 20.75 | 4 | 横浜市鶴見区 | 一級水系 | |
| 境川 | 28.51 | 1 | 藤沢市 | [2] | |
| 八ッ瀬川 | 1.20 | 1 | 小笠原村 |