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手術の目的は、病態の制御および失われた機能の回復である。直接的ではなく間接的に治療に繋がる手術もある。
;切除する
:病巣を切って取り除く手術が、局所の[[炎症]]や[[腫瘍]]に対して行われる。[[虫垂炎]]に対する虫垂切除術、[[胃癌]]に対する[[胃切除術]]や、[[乳癌]]に対する[[乳房切除術]]など。
;形成する
:[[組織 (生物学)|組織]]や[[器官]]の形を整える手術が、障害部位の機能を改善するために行われる。[[狭心症]]に対する冠動脈バイパス術、鼠径[[ヘルニア]]に対するヘルニア根治術など。