「生物の分類」の版間の差分

どのような分類体系が合理的かは、[[アリストテレス]]以来さまざまな工夫がされ、案が出されてきた。彼の『[[動物誌 (アリストテレス)|動物誌]]』では動物分類は次のようになる。

リンネは種の学名に二名法（属名と種小名の2語で表す）を採用し、分類を体系づけた。また、属・種の上位分類として、綱・目を設けて、階層的な分類体系とした。

しかしリンネの分類自体が現在もそのまま生きているわけではない。例えば、リンネは[[クジラ]]を[[魚類]]に分類していたがこれは誤りであった。また[[植物]]を[[雄蕊|おしべ]]の本数を元に分類したことは有名だが、現在の植物分類ではこの分類手法は捨てられている。

== 現在の生物分類 ==

{{mainMain|階級 (生物学)}}

| [[プロテオ古細菌界]]<ref>古細菌の界分類については安定していない。ここではユーリ古細菌界とプロテオ古細菌界に２2分する方式を採用した</ref>

| [[脊索動物門]]<br />（脊椎動物亜門）

| [[ヒト属]]<br />''Homo''

| [[ローズマリー属]]<br />{{snamei|Rosemarinus}}

| [[エノキタケ属]]<br />{{snamei||Flammulina}}

| エスケリキア属<br />{{snamei||Escherichia}}

| アエロピュルム属<br />{{snamei||Aeropyrum}}

* 中間的分類が必要なときの階級名は、その分類単位よりも上位の分類には、大 ({{lang|en|magn-}})・上 ({{lang|en|super-}}) を、下位の分類には、亜 ({{lang|en|sub-}})・下 ({{lang|en|infra-}})・小 ({{lang|en|Parv-}}) などの接頭語を各階級の頭につけて生成させる。

| -ales

| -ineae

| -aceae

| -eae（同上）

分野によっては慣習的に、よく使われる語尾がある。たとえば、動物門の -zoa、綱の -morpha、目の -iformes、-ida、古細菌門の -archaeota などである。しかしこれらはルールではなく、例外が多い。

=== 界 ===

{{mainMain|界 (分類学)}}

微生物が発見されてくると、[[1860年]]、[[エルンスト・ヘッケル]]が[[原生生物]]界を作り三界とした。さらに後には[[五界説]]、[[界_ (分類学)#八界説|八界説]]などが登場してきたが、現在から見れば過渡的な分類と言える。

{{mainMain|ドメイン (分類学)}}

! '''ウーズ<br />（[[1990年]]）<br />3ドメイン説<ref name="Woese_1990">{{cite journal | author = Woese C, Kandler O, Wheelis M | title = Towards a natural system of organisms: proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya（Eucarya.（生物の自然機構について：古細菌、細菌、真核生物の3ドメインの提案）. | u=http://www.pnas.org/cgi/reprint/87/12/4576 | journal = Proc Natl Acad Sci U S A | volume = 87 | issue = 12 | pages = 4576-9 | year = 1990 | id = PMID 2112744}}</ref>'''

2005年、国際原生生物学会から真核生物の新しい分類体系（Adl (Adl ''et al.''）) が提出された。この分類は、それまでの界の枠組みを廃し、真核生物を6つの[[スーパーグループ (分類学)|スーパーグループ]]に分類するものである。ウィキペディアの各記事でも、これらを界相当の分類として採用している場合が多い。

{| class="wikitable" style="background-color: #fff; margin-left: 0.5em;"

クロムアルベオラータについては、当時から単系統性が疑問視されていて、近年に見られる他の多くの分類では細分される傾向にある。（細分した場合には通常、ストラメノパイル、アルベオラータ、クリプト植物、ハプト植物の４4グループに分けられる。2010年現在では、[[クリプト植物]]と[[ハプト植物]]が姉妹関係にあるとして、[[有中心粒類]]を含めて、[[ハクロビア]]という分類群を形成するとする説が有力視されるようになってきている。<ref>{{PDFlink|[http://www.plankton.jp/sub08_22_01.pdf 中山剛氏（筑波大）の原生生物の記事(pdf)]}}</ref>。）　また一方では、上述のスーパーグループのうちの4つをまとめた[[バイコンタ]]が、その単系統性を有力視されるようにもなった。

|colspan="2" rowspan="2"| [[古細菌]]ドメイン

* [[サーモデスルフォバクテリウム門]]

* [[プランクトミケス門]]

* [[接合菌門]] （[[ケカビ]]、[[クモノスカビ]]）

* [[子嚢菌]]門(（[[酵母]]、[[アカパンカビ]])）

** [[テッラバクテリア]] (Terrabacteria) グラム陽性関連細菌及び藍色細菌

*** [[クロロフレクサス門]] (Chloroflexi)

**** [[バクテロイデス門]] (Bacteroidetes)

*** [[スピロヘータ]] (Spirochetes)

*** [[ユリアーキオータ門|ユリアーキオータ門]] (Euryarchaeota)

*** [[タウムアーキオータ|タウムアーキオータ門]] (Thaumarchaeota)

** [[バイコンタ]] (Bikonta) 2本[[鞭毛]]を持つ真核生物（退化により持たないものも有り）

**** 緑色植物 (Viridiplantae) ：[[被子植物]]、[[裸子植物]]、[[シダ植物]]、[[コケ植物]]、[[車軸藻類|シャジクモ藻類]]、[[緑藻]]類

**** 紅色植物 (Rhodophyta) ：[[紅藻]]類

**** [[ユーグレノゾア]] (Euglenozoa) ：[[ユーグレナ植物]]、[[キネトプラスト類]]

**** [[ヘテロロボサ]] (Heterolobosea) ：[[ネグレリア]]類、[[細胞性粘菌|アクラシス類]]

**** トリコゾア類 (Trichozoa) ：ディプロモナス類、レトルタモナス類、パラバサリア類

**** アネロモナス類 (Anaeromonada) ：オキシモナス類

**** ビコソエカ（ビコエカ）類 (Bicosoecales、, Bicoecales)

**** [[卵菌類]] (Oomycetes) ：ツユカビ類、[[ミズカビ|ミズカビ類]]

**** [[不等毛植物]]類（[[黄色植物]]類）(Heterokontophyta, Chromophyta) ：[[褐藻]]類、[[珪藻]]類

**** [[繊毛虫]]類 (Ciliata) ：[[ラッパムシ|ラッパムシ類]]、[[ゾウリムシ]]、[[ツリガネムシ]]

**** [[アピコンプレクサ]]類 (Apicomplexa) ：[[マラリア原虫]]、トキソプラズマ、[[クリプトスポリジウム]]

**** レタリア (Retaria) ：[[有孔虫]]類、[[放散虫]]類、一部の[[太陽虫]]類

**** [[ケルコゾア]] (Cercozoa) ：ケルコモナス類、[[クロララクニオン藻]]類、[[ネコブカビ]]類、ユーグリファ類

**** 葉状仮足類（ロボサ）(Lobosa) ：[[アメーバ]]類

**** コノサ (Conosa) ：[[変形菌]]、[[細胞性粘菌|タマホコリカビ類]]、アカントアメーバ類、エントアメーバ類、ペロビオンタ類

**** [[菌類]] (Fungi) ：[[子嚢菌]]類、[[担子菌]]類、[[微胞子虫]]類

**** メソミセトゾア (Mesomycetozoa) ：イクチオスポラ類