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[[Image:Chromosome.svg|thumb|[[染色体]]の構造<BR>(1) [[染色分体]] <BR>(2) [['''セントロメア]]'''<BR>(3) 短腕<BR>(4) 長腕]]
'''セントロメア'''(''Centromere'') は[[染色体]]の長腕と短腕が交差する部位。染色体のほぼ中央に位置することからこの名がつけられている。[[細胞分裂]]時には一次狭窄を形成し、紡錘体が結合する。染色体の凝縮に関係するCENP-AやINCENP、あるいは染色体の移動に関するMCAK、CENP-Eなどが集積し、[[動原体]]と呼ばれる構造を形成する。凝集した[[クロマチン]]構造、すなわちヘテロクロマチンになっており、遺伝子発現は構成的に抑制されている。[[デオキシリボ核酸|DNA]] は独自の繰り返し配列をとっており、塩基配列決定が困難である。''[[C. elegans]]'' のようにセントロメアが染色体全体に広がる生物種もある。