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'''細菌'''(さいきん、'''真正細菌'''、{{lang-la|bacterium}}、複数形 bacteria '''バクテリア''')とは、[[分類学]]上生物主要な系統([[ドメイン (分類学)|ドメイン]]の一つあるいはそこに含まれる[[古細菌]]、[[真核生物のこ]]であともに全生物界を三分する。''sn''-古細菌と合わせて[[グリセロール3-リン酸原核生物]]の脂肪酸エステルより構成さとも呼ばれる。真核生物と比較した場合、構造は非常に単純である一方、はるかに多様な[[細胞膜代謝]]系や栄養要求性持つ示す。生息環境も[[原核生物]]と定義さ考えらる全ての環境に広がっており、その生物量は膨大である。[[腸内細菌]]([[アーキア]])ドメインや発酵細菌あるいは[[真核生物病原体|病原菌]]ドメインして人の関わり深い。語源は[[ギリシャ語]]の「小さな杖」({{lang|el|βακτήριον}})、全生物界を三分す由来してい<ref>http://www.etymonline.com/index.php?term=bacteria</ref>
 
真核生物と比較した場合、構造は非常に単純である一方、はるかに多様な[[代謝]]系や栄養要求性を示し、生息環境も[[生物圏]]と考えられる全ての環境に広がっている。その生物量は膨大である。[[腸内細菌]]や発酵細菌、あるいは病原細菌として人との関わりも深い。語源は[[ギリシャ語]]の「小さな杖」({{lang|el|βακτήριον}})に由来している<ref>http://www.etymonline.com/index.php?term=bacteria</ref>。
 
== 概要 ==
細菌は、[[大腸菌]]、[[枯草菌]]、藍色細菌([[藍藻|シアノバクテリア]])など様々な系統を含む生物群である。形状は[[球菌]]か[[桿菌]]、ラセン菌が一般的で、通常1-10 µmほどの微小な生物である。核を持たないという点で[[古細菌]]と類似するが、古細菌-[[真核生物]]にいたる系統は異なる系統に属しており、両者はおおよそ35-41億年前に細菌の分岐したと考えられは極め。遺伝システムや[[タンパク質]]合成系の一部に異なる機構を採用し、[[ペプチドグリカン]]より成る[[細胞壁]]、[[エステル型脂質]]より構成される[[細胞膜]]の存在で古細菌とは区別される。1977年までは古細菌細菌に含まれると考えられていたが、現在では両者はドメインレベルで別の生物とされる。
 
細菌は[[地球]]上のあらゆる環境に存在しており、その[[代謝]]系は非常に多様である。個体数は5×10<sup>30</sup>と推定されており、その[[生物量]]も膨大である。[[光合成]]や[[窒素固定]]、[[有機物]]の分解過程など物質循環において非常に重要な位置を占めている。
 
細菌は[[地球]]上のあらゆる環境に存在しており、その[[代謝]]系は非常に多様である。個体数は5×10<sup>30</sup>と推定されており、その[[生物量]]も膨大である。[[光合成]]や[[窒素固定]]、[[有機物]]の分解過程など物質循環において非常に重要な位置を占めている。食品関係においては[[チーズ]]、[[納豆]]、[[ヨーグルト]]といった[[発酵]]過程において[[微生物]]学発展以前から用いられてきた。また、[[腸内細菌]]群は食物の消化過程には欠かすことのできない一要素である。一部のものは病原細菌として、ヒトや動物の[[感染症]]の原因になる。[[対立遺伝子]]を持たず、遺伝子型がそのまま表現型をとり、世代時間が短く変異体が得られやすい。あるいは形質転換系の確立などもあいまって近年の[[分子生物学]]を中心とした[[生物学]]は細菌を中心に発展してきた。大腸菌などは分子生物学の有用なツールとして現在でも頻繁に使用されている。
 
これまで[[ストレプトマイシン]]や[[クロラムフェニコール]]、[[テトラサイクリン]]などなど様々な細菌産生の[[抗生物質]]が発見されてきた。その製造や免疫系の新薬開発の上でも細菌の調査研究は非常に重要である。
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== 分類方法 ==
[[File:TOL20161114.png|thumb|400px|全生物の系統樹の例。この系統樹では、古細菌・真核生物の系統に対して、細菌(真正細菌)が圧倒的に優勢となっている。<br />※細菌の半分(紫色)を占める右上の"Candidate Phyla Radiation"CPR群は、2010年代に報告さまでた未培養されたことがない系統群。]]
 
=== 種の概念 ===