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*[[2000年]][[3月25日]]から[[4月9日]]に宮崎県で3戸、[[5月11日]]に北海道1戸の感染が確認、[[6月9日]]には終息。日本では92年ぶりの発生となった。
*[[2010年]]の発生
*:{{main|2010年日本における口蹄疫の流行}}
**3月
***[[3月31日]]、[[宮崎県]][[児湯郡]][[都農町]]において感染があったことが後に判明。([[3月26日]]の感染確認が始まりだったとする公式報告もある）
**4月
***[[4月9日]]、都農町の和牛1頭に口腔[[びらん]]等の症状を確認。（この段階では疑似患畜としては確認されず、公表もされていない。）
***[[4月20日]]、都農町の和牛3頭の感染の疑いが確認され公表された<ref name="miyazaki2010">[http://www.yomiuri.co.jp/national/news/20100420-OYT1T00532.htm?from=y10 宮崎の和牛3頭、口蹄疫感染の疑い]読売新聞 2010年4月20日</ref>。[[家畜伝染病予防法]]に基づき、宮崎県は当該農家から半径10キロを移動制限区域、半径20キロを搬出制限区域に指定し、消毒ポイントを設置して感染拡大の防止にあたった。
***[[4月23日]]、都農町での1例目の牛について口蹄疫（O型）と確定<ref name="moff-20100423-2"/>。
***[[4月25日]]、新たに4頭の感染が確認され、殺処分予定は1108頭に上り、過去100年間で最多となった。
***[[4月27日]]、都濃町に隣接する児湯郡川南町の豚5頭についても、口蹄疫に感染している疑いが確認された。（豚は牛より千倍程度感染性が高いとされる）
***[[4月28日]]、当初の感染例から約70km離れた宮崎県[[えびの市]]でも、感染が疑われる牛が確認された。これまではすべて宮崎県児湯郡であったが、県西端のえびの市への感染拡大に伴い、移動・搬出の制限区域が鹿児島県の一部にも拡大された。
***[[4月30日]]、相次ぐ感染報告(4月30日時点で12例の報告)から移動・搬出制限区域が4県（宮崎・鹿児島・熊本・大分）に拡大された<ref>[http://www.maff.go.jp/j/press/seisan/c_kikaku/100430.html 口蹄疫発生に伴う追加対策について]農林水産省 4月30日報道発表資料</ref>。
**5月
***[[5月4日]]、1､2,3,4,5,7,8例目の口蹄疫ウイルスが、最近アジア地域で流行しているものと近縁である(O/JPN/2010)ことが確認された<ref>[http://www.maff.go.jp/j/press/syouan/douei/100502_1.html 宮崎県において確認された口蹄疫ウイルスの分析結果について]農林水産省 5月2日報道発表資料</ref>。
***[[5月6日]]までに35農場（児湯郡都農町と川南町、えびの市）の4万4892頭(41,791頭の豚、残りは牛と水牛）が殺処分の対象になった。<ref>[http://headlines.yahoo.co.jp/hl?a=20100504-00000084-jij-pol]</ref>
<ref>[http://www.maff.go.jp/j/press/syouan/douei/100505_1.html]</ref>
===韓国===
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