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一般に、高磁場のもの程、高い空間分解能を持っている。例えば2005年10月現在、[[理化学研究所]]の脳科学総合研究センターでは4テスラの装置を使って1mm未満の空間分解能を実現している。fMRIでは高い空間分解能で脳神経活動を記録できる一方で、信号の時間変化は数秒~数十秒程度であるため、高い時間分解能は得られない欠点がある。
 
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