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==進化を扱う分子遺伝学==
遺伝情報として生物が有する[[デオキシリボ核酸|DNA]]や[[リボ核酸|RNA]]は、[[種 (分類学)|種]]の進化とともに変化する。この変化を観察することである生物種(や[[ウイルス]]等の非生物も)がどのように分化したかを調べる。形態的な分類による古典的な分類学に対し、塩基配列や酵素多型と行った遺伝情報から単位時間あたりの変異頻度が一定と仮定することで分類する。
 
理論的な体系は、[[木村資生]]の[[中立進化説]]により確立された。しかし、現在でも中立説は学会で完全遺伝子進化を解析する際否定され非常に重要な理論的基盤を提供している。
 
この分野は、分子進化学、あるいは[[分子系統学]]([[系統学]]の一分野として)、分子分類学([[分類学]]の一分野として)などとも呼ばれる。