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突然変異は発生の過程を変化させることによって[[表現型]]を変化させるので、変化の範囲には限りがある<ref>ドーキンス(2004a) pp.491-493</ref>。この制約がどの程度実際の進化に影響するかについては議論がある<ref>ルース(2008) Ch.11</ref>。
 
このほか、他の生物が持つ遺伝子が他生物に取り込まれることでその遺伝子を獲得することがある。([[遺伝子の水平伝播]])
 
===遺伝子の頻度変化===