今や人気者のアルビンは、パリのチャリティコンサートで悪乗りしすぎてデイブに大怪我をさせてしまう。デイブが入院中、家をシマリス3兄弟たちにメチャメチャにされかねないことを理由に、ゲームおたくで引きこもり中の甥のトビーと一緒に暮らすこととなる。
アルビンたちはデイブの取り計らいでトビーがかよ通っていた高校に通うことが許される。3匹はたちまち学校中の人気者となり、女子生徒の人気を全部かっさらってしまう。それが面白くなかった男子生徒らによってサイモンとセオドアは手荒い歓迎を受けることになるが、アルビンたちは反撃に転じ早々に問題を起こしてしまう。しまっピーズファンだった校長は、彼らに期末の音楽コンクールに出場して賞金を獲得するように推薦し三匹をはげ励ます。
球技の才能もあったアルビンはやがて男子生徒たちの仲間として一目おかれる存在となりフットボールチームに歓迎されアルビンのテンションは上がったが、真面目なサイモンは風紀委員の真似事などを行い、ことあるごとに彼らを刺激したので、ますますいじめられるパターンにはまり、アルビンがサイモンに「いいかげんにしてくれよ」と言えば、サイモンは「コンクールを目前にあんな連中と付き合っている場合ではない」と反論し、セオドアは間にはさまれて良よく眠れなくなり、3匹のチームワークが乱れはじ始める。
そんな情状況の中で、手ごわいライバルのシマリス3姉妹のシマしまペッツに出会う。 アルビンたちから愛想をつかされた元マネージャーのイアンはシマリス3姉妹をスカウトし、アルビンたちにシマリス3姉妹とダンスファイトでコンクールに出場する資格をかけて勝負をいど挑むように仕組んだ。ところが勝負の夜、フットボールの試合で手柄をあげたアルビンがフットボール部の連中と遊ぶことにうつつを抜かして勝負をすっぽかしたために、しまペッツに不戦敗してしまう。 ついにアルビンはサイモンとセオドアから口もきいてもらえなくなってしまい、仲間から信頼を失うことの重大さに気づく。
いっぽう一方、イアンにスカウトされたシマリス3姉妹はイアンがハリウッドももうすぐだと吹き込んだ夢に夢中となったが、イアンは長女のブリタニーばかりをひいきにしたため、面白くないジャネットとエレノアはイアンを疑うようになる。
学期末となり、音楽コンクールが開かれることとなったが、イアンはもっとシマベしまぺッツの評判を上げるための重要なショーに出ることを優先したために音楽コンクールに出ることを許さず、い「言う事を聞かなければバーベキューにする」と脅したり、ケージに閉じ込めたりするようになってしまう。 33姉妹はイアンの横暴さに嫌気がさしアルビンに助けを求めた。
アルビンは単身で33姉妹の逃走を助け、イアンが操縦する追跡用のラジコンヘリをジャックして、コンクールにぎりぎりで到着。ザ・シマッピーズとしまベぺッツは対決することをやめて共演でハイライトをもりあげ、賞金を獲得することに成功する。しまベペッツにも逃げられたイアンは悲惨な大恥をかいて舞台からつまみだ出される。
==キャスト==
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