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日本では、[[江戸時代]][[元禄]]年間に、江戸の王子付近の薬草園([[東京大学大学院理学系研究科附属植物園|小石川御薬園]])で、種子(亜麻仁)を[[薬種]]として使用するために、種子が輸入され栽培された記録がある<ref name="亜麻について">{{Cite journal |和書|author=妹尾清子|date=1998|title=亜麻について|journal=民俗服飾研究論集|issue=12|page=29-38}}</ref>。しかし当時は亜麻仁を中国から比較的安易に輸入出来たので栽培は定着しなかった。
本格的な栽培は、明治時代に入り[[北海道]]で導入された。明治元年(1871年)、プロシア人の
次第に生産が途絶えたが、2000年に若者が北海道での栽培の復活を試み、何年もの試行錯誤を経て大塚農場にて栽培が続いている<ref name="naid亜麻">{{Cite journal |和書|author=永井佳史 |date=2017-10 |title=なるべくしてなったわらしべ長者 大塚農場 代表取締役 大塚慎太郎 |url=http://agri-biz.jp/item/detail/4613 |journal=農業経営者 |volume= |issue=259 |pages=4-9 |naid=}}</ref>。種子を食用に利用するために北海道の当別町で亜麻栽培が復活し、北海道亜麻ルネサンスプロジェクトが進行している。2007年には当別町亜麻生産組合が設立されて、栽培技術の向上と普及に取り組んでいる。北海道独自の特用作物として亜麻の評価が高まるにつれて、[[十勝地方]]や[[上川地方]]に栽培が広がっている。
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