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しかし近年の系統発生解析は、キンカンがミカン属の系統に含まれることを示唆している<ref>{{Cite journal|author=Tshering Penjor|coauthors=Masashi Yamamoto, Miki Uehara, Manami Ide, Natsumi Matsumoto, Ryoji Matsumoto, Yukio Nagano|date=April 25, 2013|title=Phylogenetic Relationships of Citrus and Its Relatives Based on matK Gene Sequences|url=https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0062574|journal=PLOS ONE|language=en|volume=8|issue=4|pages=e62574 |doi=10.1371/journal.pone.0062574}}</ref>。
日本の標準和名'''キンカン'''（学名：''Citrus japonica''）とよばれる種は、別名でマルミキンカン、マルキンカンともよばれている<ref>{{YList|id=24674|taxon=Citrus japonica Thunb.|accessdate=2020-05-23}}</ref>。同属には、ナガキンカン（ナガミキンカン）<ref>{{YList|id=11637|taxon=Citrus japonica Thunb. 'Margarita'|accessdate=2020-05-23}}</ref>、ネイハキンカン（ニンポウキンカン、メイワキンカン）<ref>{{YList|id=11635|taxon=Citrus japonica Thunb. 'Crassifolia'|accessdate=2020-05-23}}</ref>、マメキンカン<ref>{{YList|id=11634|taxon=Citrus japonica Thunb. 'Hindsii'|accessdate=2020-05-23}}</ref>、チョウジュキンカン（フクシュウキンカン）<ref>{{YList|id=11642|taxon=Citrus japonica Thunb. 'Obovata'|accessdate=2020-05-23}}</ref>、近縁のなかまにトウキンカン（別名：[[カラマンシー]]）<ref>{{YList|id=11628|taxon=Citrus microcarpa Bunge|accessdate=2020-05-23}}</ref>などがある。マルキンカンは樹高が約2[[メートル]]で枝に棘があるものとないものがあり、ナガキンカンは樹高約3メートルで枝に棘がない{{sfn|田中孝治|1995|p=133}}。
日本における2010年の収穫量は3,732 トンであり、その内訳は[[宮崎県]]2,604 トン、[[鹿児島県]]873 トン、その他255 トンとなっている<ref>[http://www.e-stat.go.jp/SG1/estat/List.do?lid=000001102429 農林水産省特産果樹生産動態等調査]2013年7月23日閲覧</ref>。
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