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=== 高速バス ===
; 1番乗り場
{| class="wikitable" style="font-size:small;"
* [[中央高速バス]] 富士五湖線：[[バスタ新宿]]（[[富士急バス]]・[[フジエクスプレス]]・[[京王電鉄バス|京王バス]]）
!乗り場!!系統!!主要経由地!!行先!!運行会社!!備考
* [[東京・河口湖号|東京駅 - 河口湖線]]：[[東京駅のバス乗り場|東京駅日本橋口]]（富士急バス・富士急行観光・[[ジェイアールバス関東|JRバス関東]]）
|-
|rowspan="11"|1||[[中央高速バス]]* 富士五湖線||[[日野バスストップ|中央道日野]]||[[バスタ新宿渋谷マークシティ]]（新宿駅南口）||[[富士急バス]]<br />[[・フジエクスプレス]]<br />[[・京王電鉄バス|京王バス]]||一部の臨時便は・[[新宿駅のバス乗り場|新宿西口東急トランセ]]行）
* [[富士山駅 - 羽田空港線]]：[[品川駅]]（港南口）経由 [[東京国際空港|羽田空港]]（富士急バス・[[京浜急行バス]]）
|-
* [[池袋駅]]東口経由 [[サンシャインシティ]]プリンスホテル（富士急行観光・[[西武観光バス]]）
|東京駅 - 富士五湖・富士急ハイランド線||[[東京ドームホテル]] ※一部のみ||[[東京駅のバス乗り場|東京駅日本橋口]]||富士急バス<br />富士急行観光<br />[[ジェイアールバス関東|JRバス関東]]||
* [[川越駅]]西口経由 [[大宮駅 (埼玉県)|大宮駅]]西口（富士急行観光・西武観光バス）
|-
* [[成田国際空港|成田空港]]（富士急行観光・[[京成バス]]）
|渋谷河口湖線|| ||[[渋谷駅]]（[[渋谷マークシティ|マークシティ]]）||富士急バス<br />フジエクスプレス<br />京王バス<br />[[東急トランセ]]||
* [[津田沼駅]]経由 [[海浜幕張駅]]（富士急行観光・京成バス）
|-
* リゾートエクスプレス：[[名鉄バスセンター]]（富士急バス・[[名鉄バス]]）
|[[富士山駅 - 羽田空港線]]||[[品川駅]]（港南口）||[[東京国際空港|羽田空港]]||富士急バス<br />[[京浜急行バス]]||
* [[フジヤマライナー|FUJIYAMAライナー]]：[[京都駅]]八条口経由 [[天王寺駅・大阪阿部野橋駅バスのりば|天王寺駅（あべのハルカス）]]（富士急バス・[[近鉄バス]]）
|-
|富士山駅・河口湖 - 池袋線||[[池袋駅]]東口||[[サンシャインシティ]]プリンスホテル（池袋）||富士急行観光<br />[[西武観光バス]]||
|-
|富士山駅・河口湖 - 川越・大宮線||[[川越駅]]西口||[[大宮駅 (埼玉県)|大宮駅]]西口||富士急行観光<br />西武観光バス||
|-
|富士山駅・河口湖 - 成田空港線|| ||[[成田国際空港|成田空港]]||富士急行観光<br />[[京成バス]]||
|-
|富士山駅・河口湖 - 西船橋・津田沼・海浜幕張線||[[西船橋駅]]・[[津田沼駅]]・[[京成津田沼駅]]||[[海浜幕張駅]]||富士急行観光<br />京成バス||
|-
|富士五湖 - 飛騨高山線||[[平湯バスターミナル|平湯温泉]]||[[高山濃飛バスセンター]]||[[濃飛乗合自動車|濃飛バス]]||
|-
|リゾートエクスプレス||[[星ヶ丘駅 (愛知県)|星ヶ丘]] ※一部のみ||[[名鉄バスセンター]]||富士急バス<br />[[名鉄バス]]||
|-
|[[フジヤマライナー|FUJIYAMAライナー]]||[[京都駅]]八条口・[[大阪駅周辺バスのりば|大阪駅前（地下鉄東梅田駅）]]||[[天王寺駅・大阪阿部野橋駅バスのりば|天王寺駅（あべのハルカス）]]||富士急バス<br />[[近鉄バス]]||夜行
|}
=== 一般路線バス ===
以下、特記なき限り富士急バスが運行。
{| class="wikitable" style="font-size:small;"
!乗り場!!系統!!主要経由地!!行先!!運行会社!!備考
; 2番乗り場
|-
* タウンスニーカー 中央循環、上暮地・明見循環、熊穴・新倉循環
|rowspan="7"|2||rowspan="2"|タウンスニーカー 中央循環||[[下吉田駅]]・市役所前・[[国民健康保険富士吉田市立病院|市立病院]]||rowspan="6"|富士山駅||rowspan="7"|[[富士急バス]]||右回り
|-
; 3番乗り場
|市立病院・市役所前・下吉田駅||左回り
* A1：[[忍野八海]]・[[旭日丘バスターミナル|山中湖 旭日丘]]経由 御殿場駅（富士急モビリティと共同運行）
|-
* A2：[[北富士駐屯地]]入口・山中湖 旭日丘経由 御殿場駅（富士急モビリティと共同運行）
|rowspan="2"|タウンスニーカー 上暮地・明見循環||原・白糸町・[[寿駅]]前・向原・市立病院||右回り
* C1：お宮橋・山中湖 旭日丘・御殿場駅経由 御殿場プレミアム・アウトレット（富士急モビリティ）
|-
* C2：[[山梨県立吉田高等学校|吉田高校]]南口・山中湖 旭日丘・御殿場駅経由 御殿場プレミアム・アウトレット（富士急モビリティ）
|市立病院・向原・寿駅前・白糸町・原||左回り
* D1：北富士駐屯地正門前・山中湖 旭日丘・山中湖 平野経由 道志小学校前
|-
* D3：市役所前・お宮橋・山中湖 旭日丘・山中湖 平野経由 道志小学校前
|rowspan="2"|タウンスニーカー 熊穴・新倉循環||市立病院・熊穴団地・旭町下・下吉田中学校前・[[月江寺駅]]前||右回り
* U1：お宮橋経由 内野
|-
* ふじっ湖号（F1）：忍野八海・長池入口経由 山中湖 平野 ※右回り
|月江寺駅前・下吉田中学校前・旭町下・熊穴団地・市立病院||左回り
* ふじっ湖号（F2）：忍野八海・山中湖 旭日丘経由 山中湖 平野 ※左回り
|-
|無料巡回バス||[[富士急ハイランド駅]]||[[富士急ハイランド|ハイランドリゾートホテル&スパ]]||[[富士急グループ]]施設利用者専用
; 4番乗り場
|-
* K1：[[石和温泉駅]]経由 [[甲府駅|甲府駅北口]]
|rowspan="9"|3||ふじっ湖号（F1）||[[忍野八海]]・内野・長池入口||rowspan="2"|山中湖 平野||rowspan="2"|富士急バス||右回り
* K2：石和温泉駅経由 [[甲府駅バスターミナル|甲府駅南口]]
|-
* S4：本栖湖・[[富士宮駅]]経由 [[新富士駅 (静岡県)|新富士駅]] ※静岡県内快速運転
|ふじっ湖号（F2）||忍野八海・内野・[[旭日丘バスターミナル|山中湖 旭日丘]]||左回り
* G2：西湖民宿
|-
* A1・A2・C1・C2・ふじっ湖号（F1・F2）：河口湖駅（富士急モビリティと共同運行）
|A1||[[北口本宮冨士浅間神社|浅間神社前]]・[[北富士駐屯地]]入口・山中湖 旭日丘・仁杉||rowspan="2"|[[御殿場駅]]||rowspan="4"|富士急バス<br />[[富士急モビリティ]]||
|-
; 5番乗り場
|A2||浅間神社前・忍野八海・[[ファナック]]前・山中湖 旭日丘・仁杉||
* 富士登山バス（M）：[[富士登山|富士スバルライン五合目]]
|-
* 馬返バス：[[富士登山|馬返]]（[[富士急山梨ハイヤー]]） ※季節運行
|C1||浅間神社前・お宮橋・内野・山中湖 旭日丘・中畑・御殿場駅||rowspan="2"|[[御殿場プレミアム・アウトレット]]||
|-
|C2||[[山梨県立吉田高等学校|吉田高校]]南口・内野・山中湖 旭日丘・中畑・御殿場駅||
|-
|D1||浅間神社前・北富士駐屯地正門前・山中湖 旭日丘・山中湖 平野||rowspan="2"|道志小学校前||rowspan="3"|富士急バス||rowspan="2"|平日運行
|-
|D3||市役所前・お宮橋・内野・山中湖 旭日丘・山中湖 平野
|-
|U1||浅間神社前・お宮橋||内野||
|-
|rowspan="11"|4||K1||[[富士急ハイランド]]・[[河口湖駅]]・[[三つ峠|三ツ峠]]入口・[[石和温泉駅]]・[[愛宕トンネル有料道路|愛宕トンネル]]||[[甲府駅|甲府駅北口]]||rowspan="8"|富士急バス||
|-
|K2||富士急ハイランド・河口湖駅・遊覧船・[[〜河口湖〜 富士山パノラマロープウェイ|ロープウェイ]]入口・三ツ峠入口・十郎橋・石和温泉駅・[[山梨学院大学]]前||rowspan="2"|[[甲府駅バスターミナル|甲府駅]]||
|-
|K3||三ツ峠入口・十郎橋・石和温泉駅・山梨学院大学前||新倉河口湖トンネル経由
|-
|P1||富士急ハイランド・河口湖駅・遊覧船・ロープウェイ入口||大石プチペンション村||
|-
|P2||富士急ハイランド・河口湖駅・遊覧船・ロープウェイ入口・大石プチペンション村||芦川農産物直売所||
|-
|S1||富士急ハイランド・河口湖駅・勝山・富士緑の休暇村・[[富岳風穴|風穴]]・[[精進湖|精進]]||[[本栖湖]]||
|-
|S2||[[山梨県立富士北稜高等学校|富士北陵高校]]・富士急ハイランド・河口湖駅・勝山||富士緑の休暇村||平日運行
|-
|S3||富士急ハイランド・河口湖駅・勝山・富士緑の休暇村・風穴・精進・本栖湖・[[甲斐常葉駅]]・[[下部温泉駅]]||[[下部温泉|下部温泉郷]]||
|-
|S4||富士急ハイランド・河口湖駅・勝山・富士緑の休暇村・風穴・精進・本栖湖・[[富士宮駅]]||[[新富士駅 (静岡県)|新富士駅]]||富士急バス<br />[[富士急静岡バス]]||静岡県内快速運転
|-
|G2||富士急ハイランド・河口湖駅・勝山・長浜||[[西湖 (富士五湖)|西湖]]民宿||富士急バス||
|-
|A1・A2・C1・C2・ふじっ湖号（F1・F2）||富士急ハイランド||河口湖駅||富士急バス<br />富士急モビリティ||
|-
|rowspan="2"|5||富士登山バス（M）||[[山梨県立富士山世界遺産センター|富士山世界遺産センター]]・富士山パーキング・四合目大沢展望台||[[富士登山|富士スバルライン五合目]]||富士急バス||
|-
|馬返バス||中の茶屋||馬返||[[富士急山梨ハイヤー]]||季節運行
|-
|6||富士山世界遺産ループバス（W）|| ||河口湖駅||富士急バス||
|}
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