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'''クロムアルベオラータ'''（Chromalveolata）は[[真核生物]]の系統についての仮説である。1999年に[[Cavalier-Smith]]が提唱したもので、[[クロミスタ]]と[[アルベオラータ]]に属する生物は、[[紅藻]]由来の[[色素体]]を持つ[[光合成]]性の共通祖先から発展してきたとするものである。これまでに得られた分子系統解析の結果を総合するとこの仮説は妥当とされることが多いが、批判もあり広く受け入れられるには至っていない。

*[[アルベオラータ]] ：[[繊毛虫]]・[[アピコンプレクサ]]・[[渦鞭毛藻]]

この仮説の根底にあるのは、非常に多様な[[藻類]]が[[クロロフィル]]cを持っていることに対する疑問である。1981年にCavalier-Smithが提唱した[[クロミスタ]]界にはその後の改変を経て、クロロフィルcを持つクリプト藻、ハプト藻、不等毛類（[[褐藻]]・[[珪藻]]など）ストラメノパイルが含められていたが、それ以外に[[渦鞭毛藻]]も多くのものがクロロフィルcを持っている。クロロフィルcを持つ生物はそれぞれ別個に成立したという考え方もされていたが、Cavalier-Smithは１回の二次共生現象で説明することを好んだ。

Cavalier-Smith (1999)は、クロミスタとアルベオラータが姉妹関係にあること、クロミスタの4重の[[葉緑体]]膜と渦鞭毛藻の3重の葉緑体膜とが相同であること、マラリア原虫などに発見されたクロロフィルを含まない色素体も同じ紅藻起源であることを主張し、この一群をクロムアルベオレート類（chromalveolates）と呼んだ。すなわち、全てのクロムアルベオレート類は、単細胞の紅藻を細胞内共生により取り込んでできた、クロロフィルcを含む色素体を持つ光合成生物を共通祖先とする、という仮説である。クロムアルベオレート類には、光合成生物のみならず、[[繊毛虫]]や[[ラビリンチュラ]]のような非光合成生物も含まれる。

アルベオラータ（[[繊毛虫]]・[[アピコンプレクサ]]・[[渦鞭毛藻]]）が単系統であることについては当時から広く受け入れられていて、特定の変わった生物が本当にここに含まれるのかどうかという議論を除けば現在でも特に異論は出ていない。しかしクロミスタ（クリプト藻、ハプト藻、不等毛類）の単系統性については結論が出ておらず、分子系統解析を行うとそれぞれバラバラになることが多い。たとえばHarper ''et al.'' (2005)のように、不等毛類ストラメノパイルについては確かにアルベオラータと姉妹関係にあるという結果が出ることも多いのだが、クロムアルベオラータが全体として一つの群を成すという積極的な解析結果はない。

それでもクロムアルベオラータという仮説がある程度の支持を集めているのは、GAPDH遺伝子の解析結果によるところが大きい。GAPDH（glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase、グリセルアルデヒド3-リン酸脱水素酵素）は[[解糖系]]を構成し、また植物では光合成の[[暗反応]]に関わる重要な酵素である。緑色植物や紅藻の色素体GAPDHの遺伝子は[[シアノバクテリア]]に由来するのに対して、渦鞭毛藻やクリプト藻の色素体GAPDHの遺伝子は細胞質GAPDHの遺伝子に似ていることが知られていた。そこでFast ''et al.'' (2001)が、アピコンプレクサや[[ラフィド藻]]（不等毛類藻の一種）のGAPDH遺伝子を同定して分子系統解析を行った結果、アピコンプレクサ、渦鞭毛藻、ラフィド藻、クリプト藻の色素体GAPDHの遺伝子は単系統となることがわかった。しかもその後Yoon ''et al.'' (2002)によって、クロミスタの色素体が共通の起源を持ちそれが紅藻であるということが、色素体ゲノム上の複数の遺伝子（16S rRNA, ''psa''A, ''psb''A, ''rbc''L, ''tuf''A）を使った系統解析により極めて明瞭に示されている。このことからアピコンプレクサと渦鞭毛藻の色素体の起源は共通であり、さらにクロミスタの色素体の起源とも共通していると考えられるようになった。

*:プロテオバクテリア由来が1回（[[ミトコンドリア]]）、シアノバクテリア由来が2回（一次共生の色素体と''Paulinella chromatophora''の色素体）、[[緑藻]]由来が3回（[[ミドリムシユーグレナ藻]]、[[クロララクニオン藻]]と一部の[[渦鞭毛藻]]の色素体）、二次共生藻類由来が少なくとも2回（渦鞭毛藻で見られる三次共生の色素体）など、紅藻由来以外のものだけで8回以上起きている。

*:系統的により原始的な位置を占めるグループ(（例えば[[卵菌]]や[[繊毛虫]])）がみな色素体を持っていないため、共通祖先が色素体を獲得したものが現在まで引き継がれているとすると、色素体の喪失が無数に起きたことになる。

*:しかし色素体が光合成能を失っても代謝を担う痕跡器官として残ることが多く、過去に確実に色素体を持っていたが失っているという生物はほとんど知られていない（[[卵菌]]だけはその可能性が高い）。

*:極端な例えをすると、最初に紅藻由来の色素体を持つハプト藻が成立したあと、それぞれバラバラな生物がハプト藻を捕食する（三次共生）ことでクリプト藻や渦鞭毛藻や不等毛類藻が生じた場合でも、系統解析をすれば「色素体の起源」は単一という結果が得られる。実際にそのような渦鞭毛藻がいる。