長崎商工会議所(ながさきしょうこうかいぎしょ)は、主に長崎県長崎市内に事業所をおく企業・団体で運営されている商工会議所。
1879年(明治12年)10月我が国5番目の商法会議所として設立。
長崎市内の法人・個人事業所による加入・脱退自由の任意加入制に基づく会員制の組織。