KHDRBS1(KH domain-containing, RNA-binding, signal transduction-associated protein 1)またはSam68(Src-associated substrate in mitosis of 68 kDa)は、ヒトではKHDRBS1遺伝子にコードされるタンパク質である[5][6]

KHDRBS1
PDBに登録されている構造
PDBオルソログ検索: RCSB PDBe PDBj
PDBのIDコード一覧

2XA6, 3QHE

識別子
記号KHDRBS1, Sam68, p62, p68, KH domain containing, RNA binding, signal transduction associated 1, KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 1
外部IDOMIM: 602489 MGI: 893579 HomoloGene: 4781 GeneCards: KHDRBS1
遺伝子の位置 (ヒト)
1番染色体 (ヒト)
染色体1番染色体 (ヒト)[1]
1番染色体 (ヒト)
KHDRBS1遺伝子の位置
KHDRBS1遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点32,013,868 bp[1]
終点32,060,850 bp[1]
遺伝子の位置 (マウス)
4番染色体 (マウス)
染色体4番染色体 (マウス)[2]
4番染色体 (マウス)
KHDRBS1遺伝子の位置
KHDRBS1遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点129,596,957 bp[2]
終点129,636,096 bp[2]
RNA発現パターン


さらなる参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能 DNA結合
poly(A) binding
poly(U) RNA binding
SH3 domain binding
protein-containing complex binding
血漿タンパク結合
RNA結合
核酸結合
protein domain specific binding
identical protein binding
細胞の構成要素 細胞質
Grb2-Sos complex

細胞核
細胞質基質
核質
生物学的プロセス regulation of transcription, DNA-templated
タンパク質安定性の制御
transcription, DNA-templated
positive regulation of RNA export from nucleus
細胞表面受容体シグナル伝達経路
G2/M transition of mitotic cell cycle
regulation of RNA export from nucleus
細胞周期
細胞増殖
negative regulation of transcription, DNA-templated
positive regulation of translational initiation
シグナル伝達
mRNA processing
positive regulation of signal transduction
regulation of mRNA splicing, via spliceosome
精子形成
protein complex oligomerization
regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome
G1/S transition of mitotic cell cycle
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
ヒトマウス
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq
(mRNA)

NM_001271878
NM_006559

NM_011317

RefSeq
(タンパク質)

NP_001258807
NP_006550

NP_035447

場所
(UCSC)
Chr 1: 32.01 – 32.06 MbChr 1: 129.6 – 129.64 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
閲覧/編集 ヒト閲覧/編集 マウス

このタンパク質は多くの機能を持っているようであり、選択的スプライシング細胞周期の調節、RNAの3'末端の形成、腫瘍形成、HIVの遺伝子発現の調節など、多様な細胞過程に関与している可能性がある[7]

機能 編集

Sam68は公式にはKHDRBS1と呼ばれる。Sam68はKHドメインを持つRNA結合タンパク質で、U(U/A)AAの定方向リピートを比較的高い親和性で認識する[8][9]。Sam68は主にに存在し、核内での主要な機能は、選択的スプライシングにおいて選択的エクソンに隣接するRNA配列を認識し、スプライシングを調節することである。

臨床的意義 編集

Sam68は神経発生アディポジェネシス英語版などの過程や、脊髄性筋萎縮症がんなどの疾患過程に中心的な役割を果たしている多数の遺伝子に対し、選択的スプライシングによって調節を行う。

神経発生 編集

選択的スプライシングを検出可能なマイクロアレイによって、正常な神経発生に関係するmRNAの選択的スプライシングにSam68が関与していることが示されている[10]。また、Sam68はSF2/ASFの選択的スプライシングを調節することで、上皮間葉転換に関与していることが示されている[11]。Sam68は中枢神経系において、神経活動依存的にニューレキシン1の選択的スプライシングを調節することが示されており、神経発達障害と関係していることが示唆されている[12]

アディポジェネシス 編集

Sam68はmTORキナーゼの選択的スプライシングに影響を与え、Sam68欠損マウスで観察される痩せ表現型に寄与している[13]

脊髄性筋萎縮症 編集

Sam68は脊髄性筋萎縮症と関係するSMN2遺伝子のエクソン7のスキッピングを促進し、機能的でないSMN2タンパク質の産生をもたらす[11]

がん 編集

Sam68は多数のがん関連遺伝子の選択的スプライシングを調節する。

Sam68が選択的スプライシングに関与しているという直接的証拠は、CD44のエクソンv5の組み込みを促進することから得られた[14][15]。エクソンv5の組み込みは、細胞遊走能と相関している。CD44は細胞表面タンパク質で、その発現は多数の腫瘍のタイプにおいて予後の予測に利用されている[16][17]前立腺がんでは、Sam68はスプライシング複合体タンパク質KHDRBS3(T-STAR)、メタドヘリン(MTDH)とも相互作用し、これらもCD44のスプライシングを変化させる[17]。後に、Sam68のノックダウンによってLNCaP前立腺がん細胞の増殖が遅れることが示された[18]

さらに、Sam68はhnRNP A1とともにBcl-x英語版の選択的5'スプライス部位の選択に影響を与え、生存促進経路とアポトーシス経路を調節する[19]

Sam68のRNA結合活性は翻訳後修飾によって調節されている。成長因子Srcファミリーキナーゼなどの可溶性チロシンキナーゼからのシグナルを受けて選択的スプライシングなどの細胞内RNA過程を調節する作用を示すため、STAR(Signal Transduction Activator of RNA)タンパク質と呼ばれることも多い[20]。例えば、CD44のSam68依存的なエクソンv5の選択的スプライシングはERKによるSam68のリン酸化によって調節され[15]、Bcl-xの選択的スプライシングはp59-FYN依存的なリン酸化によって調節される[19]

また、Sam68は上皮成長因子受容体(EGFR)[21]肝細胞増殖因子(HGF)/Met受容体(c-Met[22]レプチン[23]腫瘍壊死因子(TNF)受容体[24]の下流因子である。これらの過程におけるSam68の役割は少しずつ明らかになりつつあるが、大部分は未解明である。Sam68は細胞質の細胞膜近傍に再局在することも示されており、そこでは特定のmRNAを輸送して翻訳を調節し[25]、細胞遊走を調節する[21]

がんにおけるSam68の多様な役割についてはBielliらによる総説[26]にまとめられている。

遺伝子ノックアウト研究 編集

Sam68欠損マウスは、sam68遺伝子のKHドメインの機能的領域をコードするエクソン4–5を破壊することによって作製された[27]ヘテロ接合型マウスの交配による仔の遺伝子型は、E18.5の時点ではメンデル型の分離パターンを示す。目に見える奇形は存在しないにもかかわらず、 Sam68-/-マウスの多くは不明な原因によって出生時に死亡する[27]。Sam68+/-マウスの表現型は正常であり、周産期を生存したSam68-/-マウスも変わらず老齢まで生存する。Sam68-/-マウスは同時に生まれたSam68+/+マウスよりも体重が軽く、若いSam68-/-マウスは肥満度が大きく低下していることがMRIによって確認されているが、両者の摂食行動は同程度である[13]。さらに、Sam68-/-マウスは食餌誘発性肥満から保護される[13]。Sam68欠損脂肪前駆細胞(3T3-L1細胞)ではアディポジェネシスが損なわれ、Sam68-/-マウスの白色脂肪組織の間質血管細胞群(SVF)中の成体幹細胞(ADSC)は45%減少していた[13]

In vivoでの腫瘍形成 編集

Sam68-/-マウスでは腫瘍形成はみられず、免疫疾患や他の主要な疾患もみられない。しかし、Sam68-/-マウスは雄性不妊[25][27]とメスの低受胎[28]のために繁殖が困難である。Sam68欠損マウスは協調運動障害がみられ、野生型と比較してより低速でより早く回転ドラムから脱落する[29]。Sam68-/-マウスは加齢による骨粗鬆症から保護される[27]マウス乳癌ウイルス-ポリオーマミドルT抗原(MMTV-PyMT)による乳房腫瘍形成マウスモデルにおいては、Sam68の発現の低下によって腫瘍量が減少し転移が低下することが示されている[30]カプラン・マイヤー生存曲線からは、1つのsam68アレルの喪失(PyMT; Sam68+/-)が触知腫瘤の発生の有意な遅れや腫瘍の多発性(multiplicity)の有意な減少と関係していることが示されている。これらの発見は、Sam68がPyMT誘導性の乳房腫瘍形成に必要であることを示唆している。胸腺欠損マウスにおいて、PyMT形質転換乳房細胞でのSam68の発現のノックダウンは肺腫瘍の病巣数を減少させることから、Sam68が乳房腫瘍の転移にも必要であることが示唆されている。

出典 編集

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000121774 - Ensembl, May 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000028790 - Ensembl, May 2017
  3. ^ Human PubMed Reference:
  4. ^ Mouse PubMed Reference:
  5. ^ “Molecular cloning and nucleic acid binding properties of the GAP-associated tyrosine phosphoprotein p62”. Cell 69 (3): 551–8. (Jun 1992). doi:10.1016/0092-8674(92)90455-L. PMID 1374686. 
  6. ^ “Salpalpha and Salpbeta, growth-arresting homologs of Sam68”. Gene 240 (1): 133–47. (Jan 2000). doi:10.1016/S0378-1119(99)00421-7. PMID 10564820. 
  7. ^ Entrez Gene: KH domain containing, RNA binding, signal transduction associated 1”. 2020年11月28日閲覧。
  8. ^ “The STAR RNA binding proteins GLD-1, QKI, SAM68 and SLM-2 bind bipartite RNA motifs”. BMC Mol Biol 10 (47): 47. (May 2009). doi:10.1186/1471-2199-10-47. PMC 2697983. PMID 19457263. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2697983/. 
  9. ^ “Specificity and determinants of Sam68 RNA binding. Implications for the biological function of K homology domains”. J Biol Chem 272 (43): 27274–27280. (Oct 1997). doi:10.1074/jbc.272.43.27274. PMID 9341174. 
  10. ^ “Sam68 regulates a set of alternatively spliced exons during neurogenesis”. Mol Cell Biol 29 (1): 201–13. (Jan 2009). doi:10.1128/MCB.01349-08. PMC 2612485. PMID 18936165. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2612485/. 
  11. ^ a b “The splicing regulator Sam68 binds to a novel exonic splicing silencer and functions in SMN2 alternative splicing in spinal muscular atrophy”. EMBO J 29 (7): 1235–47. (Apr 2010). doi:10.1038/emboj.2010.19. PMC 2857462. PMID 20186123. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2857462/. 
  12. ^ “SAM68 regulates neuronal activity-dependent alternative splicing of neurexin-1”. Cell 147 (7): 1601–14. (Dec 2011). doi:10.1016/j.cell.2011.11.028. PMC 3246220. PMID 22196734. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3246220/. 
  13. ^ a b c d “The Sam68 STAR RNA-binding protein regulates mTOR alternative splicing during adipogenesis”. Mol Cell 46 (2): 187–99. (Apr 2012). doi:10.1016/j.molcel.2012.02.007. PMID 22424772. 
  14. ^ “Regulation of CD44 alternative splicing by SRm160 and its potential role in tumor cell invasion”. Mol Cell Biol 26 (1): 362–70. (Jan 2006). doi:10.1128/MCB.26.1.362-370.2006. PMC 1317625. PMID 16354706. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1317625/. 
  15. ^ a b “Signal-dependent regulation of splicing via phosphorylation of Sam68”. Nature 420 (6916): 691–5. (Dec 2002). doi:10.1038/nature01153. PMID 12478298. 
  16. ^ Naor, David; Nedvetzki, Shlomo; Golan, Itshak; Melnik, Lora; Faitelson, Yoram (November 2002). “CD44 in cancer”. Critical Reviews in Clinical Laboratory Sciences 39 (6): 527–579. doi:10.1080/10408360290795574. ISSN 1040-8363. PMID 12484499. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/12484499. 
  17. ^ a b Luxton, Hayley J.; Simpson, Benjamin S.; Mills, Ian G.; Brindle, Nicola R.; Ahmed, Zeba; Stavrinides, Vasilis; Heavey, Susan; Stamm, Stefan et al. (2019-08-23). “The Oncogene Metadherin Interacts with the Known Splicing Proteins YTHDC1, Sam68 and T-STAR and Plays a Novel Role in Alternative mRNA Splicing”. Cancers 11 (9). doi:10.3390/cancers11091233. ISSN 2072-6694. PMC 6770463. PMID 31450747. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31450747. 
  18. ^ “The RNA-binding protein Sam68 contributes to proliferation and survival of human prostate cancer cells”. Oncogene 26 (30): 4372–82. (Jun 2007). doi:10.1038/sj.onc.1210224. PMID 17237817. 
  19. ^ a b “The RNA-binding protein Sam68 modulates the alternative splicing of Bcl-x”. J Cell Biol 176 (7): 929–39. (Mar 2007). doi:10.1083/jcb.200701005. PMC 2064079. PMID 17371836. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2064079/. 
  20. ^ Richard S (2010). Reaching for the stars: Linking RNA binding proteins to diseases. Advances in Experimental Medicine and Biology. 693. 142–57. doi:10.1007/978-1-4419-7005-3_10. ISBN 978-1-4419-7004-6. PMID 21189691 
  21. ^ a b “Identification of a Sam68 ribonucleoprotein complex regulated by epidermal growth factor”. J Biol Chem 284 (46): 31903–13. (Nov 2009). doi:10.1074/jbc.M109.018465. PMC 2797261. PMID 19762470. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2797261/. 
  22. ^ “Met receptors induce Sam68-dependent cell migration by activation of alternate extracellular signal-regulated kinase family members”. J Biol Chem 286 (24): 21062–72. (Jun 2011). doi:10.1074/jbc.M110.211409. PMC 3122167. PMID 21489997. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3122167/. 
  23. ^ “Sam68 and ERKs regulate leptin-induced expression of OB-Rb mRNA in C2C12 myotubes”. Mol Cell Endocrinol 309 (1–2): 26–31. (Oct 2009). doi:10.1016/j.mce.2009.05.021. PMID 19524014. https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00507140/file/PEER_stage2_10.1016%252Fj.mce.2009.05.021.pdf. 
  24. ^ “Sam68 is required for both NF-κB activation and apoptosis signaling by the TNF receptor”. Mol Cell 43 (2): 167–79. (Jul 2011). doi:10.1016/j.molcel.2011.05.007. PMC 3142289. PMID 21620750. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3142289/. 
  25. ^ a b “Sam68 regulates translation of target mRNAs in male germ cells, necessary for mouse spermatogenesis”. J Cell Biol 185 (2): 235–49. (Apr 2009). doi:10.1083/jcb.200811138. PMC 2700383. PMID 19380878. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2700383/. 
  26. ^ “The RNA-binding protein Sam68 is a multifunctional player in human cancer”. Endocr Relat Cancer 18 (4): R91–R102. (Jul 2011). doi:10.1530/ERC-11-0041. hdl:2108/88068. PMID 21565971. https://art.torvergata.it/bitstream/2108/88068/1/Bielli%20et%20al.%2c%20ERC%202011.pdf. 
  27. ^ a b c d “Ablation of the Sam68 RNA binding protein protects mice from age-related bone loss”. PLoS Genet 1 (6): e74. (Dec 2005). doi:10.1371/journal.pgen.0010074. PMC 1315279. PMID 16362077. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1315279/. 
  28. ^ “Ablation of the Sam68 gene impairs female fertility and gonadotropin-dependent follicle development”. Hum Mol Genet 19 (24): 4886–94. (Dec 2010). doi:10.1093/hmg/ddq422. PMID 20881015. 
  29. ^ “Motor coordination defects in mice deficient for the Sam68 RNA-binding protein”. Behav Brain Res 189 (2): 357–63. (Jun 2008). doi:10.1016/j.bbr.2008.01.010. PMID 18325609. 
  30. ^ “Sam68 haploinsufficiency delays onset of mammary tumorigenesis and metastasis”. Oncogene 27 (4): 548–56. (Jan 2008). doi:10.1038/sj.onc.1210652. PMID 17621265. 

関連文献 編集