Oct-4 (octamer-binding transcription factor 4) または、POU5F1 (POU domain, class 5, transcription factor 1)は、POU5F1 遺伝子によってコードされているヒトタンパク質の一つである[5]。Oct-4はPOU(Pit-Oct-Unc)ドメインをもつ転写因子群であるPOUファミリーのホメオドメイン転写因子であり、未分化胚性幹細胞の自己複製に密接に関与している[6]。それ故、Oct-4は未分化細胞のマーカーとして頻用される。Oct-4の発現は厳密に調節されており、その発現の増加ないし抑制が細胞の分化を誘導すると考えられている[7]

POU5F1
PDBに登録されている構造
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PDBのIDコード一覧

1OCP, 3L1P

識別子
記号POU5F1, OCT3, OCT4, OTF-3, OTF3, OTF4, Oct-3, Oct-4, POU class 5 homeobox 1, Oct3/4
外部IDOMIM: 164177 MGI: 101893 HomoloGene: 8422 GeneCards: POU5F1
遺伝子の位置 (ヒト)
6番染色体 (ヒト)
染色体6番染色体 (ヒト)[1]
6番染色体 (ヒト)
POU5F1遺伝子の位置
POU5F1遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点31,164,337 bp[1]
終点31,180,731 bp[1]
遺伝子の位置 (マウス)
17番染色体 (マウス)
染色体17番染色体 (マウス)[2]
17番染色体 (マウス)
POU5F1遺伝子の位置
POU5F1遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点35,816,915 bp[2]
終点35,821,669 bp[2]
RNA発現パターン




さらなる参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能 DNA結合
sequence-specific DNA binding
miRNA binding
DNA-binding transcription factor activity
転写因子結合
transcription cis-regulatory region binding
血漿タンパク結合
DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
ubiquitin protein ligase binding
RNA結合
細胞の構成要素 細胞質
細胞質基質
transcription regulator complex
核質
細胞核
ミトコンドリア
生物学的プロセス regulation of transcription, DNA-templated
somatic stem cell population maintenance
negative regulation of gene silencing by miRNA
cell fate commitment involved in formation of primary germ layer
endodermal cell fate specification
解剖学的構造の形態形成
mRNA transcription by RNA polymerase II
regulation of asymmetric cell division
negative regulation of transcription by RNA polymerase II
transcription by RNA polymerase II
transcription, DNA-templated
regulation of DNA methylation-dependent heterochromatin assembly
多細胞個体の発生
cardiac cell fate determination
response to wounding
BMP signaling pathway involved in heart induction
遺伝子発現調節
regulation of heart induction by regulation of canonical Wnt signaling pathway
blastocyst development
positive regulation of transcription by RNA polymerase II
positive regulation of SMAD protein signal transduction
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
ヒトマウス
Entrez
Ensembl
ENSG00000230336
ENSG00000206454
ENSG00000204531
ENSG00000237582
ENSG00000229094
UniProt
RefSeq
(mRNA)

NM_203289
NM_001173531
NM_001285986
NM_001285987
NM_002701

NM_001252452
NM_013633

RefSeq
(タンパク質)
NP_001167002
NP_001272915
NP_001272916
NP_002692
NP_976034

NP_001272915.1

NP_001239381
NP_038661

場所
(UCSC)
Chr 6: 31.16 – 31.18 MbChr 6: 35.82 – 35.82 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
閲覧/編集 ヒト閲覧/編集 マウス

出典

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  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000230336、ENSG00000206454、ENSG00000204531、ENSG00000237582、ENSG00000229094、ENSG00000233911、ENSG00000235068 - Ensembl, May 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000024406 - Ensembl, May 2017
  3. ^ Human PubMed Reference:
  4. ^ Mouse PubMed Reference:
  5. ^ Takeda J, Seino S, Bell GI (September 1992). “Human Oct3 gene family: cDNA sequences, alternative splicing, gene organization, chromosomal location, and expression at low levels in adult tissues”. Nucleic Acids Res. 20 (17): 4613–20. doi:10.1093/nar/20.17.4613. PMC 334192. PMID 1408763. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC334192/. 
  6. ^ Young Lab- Core Transcriptional Regulatory Circuitry in Human Embryonic Stem Cells at MIT
  7. ^ Niwa H, Miyazaki J, Smith AG (April 2000). “Quantitative expression of Oct-3/4 defines differentiation, dedifferentiation or self-renewal of ES cells”. Nat. Genet. 24 (4): 372–6. doi:10.1038/74199. PMID 10742100. 

外部リンク

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