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円石藻 Gephyrocapsa oceanica

ハクロビア(Hacrobia)は、SARスーパーグループを含まないクロムアルベオラータ単系統群[1]として提唱されている分類である。"ha-"はハプト藻、"-cr-"はクリプト藻に由来し、"-bia"は生物を表す接尾辞である[2]。他に、CCTH (Cryptophyta, Centrohelida, Telonemia and Haptophyta)[3]や"Eukaryomonadae"[4]とも呼ばれる。

2012年2月時点で、このグループが単系統群であるか否かは分かっていない[3]。2012年の2つの研究では、正反対の結果が得られている[5][3]

メンバー編集

過去にはストラメノパイル、ハプト藻、クリプト藻は、全てクロミスタに分類されたことがあったが[6]、現在ではストラメノパイルは除外され、ハプト藻とクリプト藻は近い関係にあると考えられている[7][8](そして"Cryptophyta+Haptophyta"グループと総称されることもある)[9]。2009年の論文では、テロネマ門中心粒太陽虫を、ハプト藻、クリプト藻と併せて新たな分類を形成することが提案された[10]ピコビリ藻もこの分類に入る可能性があるが、情報が少なく確定には至っていない[2]

最近のいくつかの研究では、ハプト藻とクリプト藻は単系統群ではないと結論付けられている[11]。前者はSARスーパーグループの姉妹群であり、後者はアーケプラスチダに近いとされている[5]。2012年2月時点では、ハクロビアが単系統群であるか否かははっきり分かっていない[3]

出典編集

  1. ^ Sakaguchi M, Takishita K, Matsumoto T, Hashimoto T, Inagaki Y (July 2009). “Tracing back EFL gene evolution in the cryptomonads-haptophytes assemblage: separate origins of EFL genes in haptophytes, photosynthetic cryptomonads, and goniomonads”. Gene 441 (1-2): 126–31. doi:10.1016/j.gene.2008.05.010. PMID 18585873. http://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0378-1119(08)00219-9. 
  2. ^ a b “Molecular phylogeny and description of the novel katablepharid Roombia truncata gen. et sp. nov., and establishment of the Hacrobia taxon nov”. PLoS ONE 4 (9): e7080. (September 2009). doi:10.1371/journal.pone.0007080. PMID 19759916. http://dx.plos.org/10.1371/journal.pone.0007080. 
  3. ^ a b c d Zhao, Sen; Burki, Fabien; Bråte, Jon; Keeling, Patrick J.; Klaveness, Dag; Shalchian-Tabrizi, Kamran (2012). “Collodictyon—An Ancient Lineage in the Tree of Eukaryotes”. Molecular Biology and Evolution 29 (6): 1557–68. doi:10.1093/molbev/mss001. PMC: 3351787. PMID 22319147. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3351787/ 2012年3月2日閲覧。. 
  4. ^ EUKARYOMONADAE”. 2010年7月19日閲覧。
  5. ^ a b Burki, F.; Okamoto, N.; Pombert, J.F. & Keeling, P.J. (2012). “The evolutionary history of haptophytes and cryptophytes: phylogenomic evidence for separate origins”. Proc. Biol. Sci.. doi:10.1098/rspb.2011.2301. 
  6. ^ Csurös M, Rogozin IB, Koonin EV (May 2008). “Extremely intron-rich genes in the alveolate ancestors inferred with a flexible maximum-likelihood approach”. Mol. Biol. Evol. 25 (5): 903–11. doi:10.1093/molbev/msn039. PMID 18296415. http://mbe.oxfordjournals.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=18296415. 
  7. ^ Rice DW, Palmer JD (2006). “An exceptional horizontal gene transfer in plastids: gene replacement by a distant bacterial paralog and evidence that haptophyte and cryptophyte plastids are sisters”. BMC Biol. 4: 31. doi:10.1186/1741-7007-4-31. PMC: 1570145. PMID 16956407. http://www.biomedcentral.com/1741-7007/4/31. 
  8. ^ Aharon Oren; R. Thane Papke (1 July 2010). Molecular Phylogeny of Microorganisms. Horizon Scientific Press. pp. 190–. ISBN 978-1-904455-67-7. http://books.google.com/books?id=a5t9DYZ-wccC&pg=PA190 2011年1月21日閲覧。. 
  9. ^ Reeb VC, Peglar MT, Yoon HS, et al. (May 2009). “Interrelationships of chromalveolates within a broadly sampled tree of photosynthetic protists”. Mol. Phylogenet. Evol. 53 (1): 202–11. doi:10.1016/j.ympev.2009.04.012. PMID 19398025. http://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S1055-7903(09)00144-4. 
  10. ^ Burki, F; Inagaki, Y; Bråte, J; Archibald, J.; Keeling, P.; Cavalier-Smith, T; Sakaguchi, M; Hashimoto, T; Horak, A; Kumar, S; Klaveness, D; Jakobsen, K.S; Pawlowski, J; Shalchian-Tabrizi, K (2009). “Large-scale phylogenomic analyses reveal that two enigmatic protist lineages, Telonemia and Centroheliozoa, are related to photosynthetic chromalveolates.” (Free full text). Genome Biology and Evolution 1: 231–8. doi:10.1093/gbe/evp022. PMC: 2817417. PMID 20333193. オリジナルの2012年7月10日時点によるアーカイブ。. https://archive.is/20120710011541/http://gbe.oxfordjournals.org/cgi/content/short/evp022v1?rss=1. 
  11. ^ Baurain, Denis; Brinkmann, Henner; Petersen, Jörn; Rodríguez-Ezpeleta, Naiara; Stechmann, Alexandra; Demoulin, Vincent; Roger, Andrew J.; Burger, Gertraud et al. (2010), “Phylogenomic Evidence for Separate Acquisition of Plastids in Cryptophytes, Haptophytes, and Stramenopiles”, Molecular Biology and Evolution 27 (7): 1698–1709, doi:10.1093/molbev/msq059 

外部リンク編集