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== 沿革 ==
[[永久 (日本)|永久]]3年（[[1115年]]）、[[左大臣]] [[源俊房]]の子で醍醐寺14代[[座主]][[勝覚]]が開く。当初は'''灌頂院'''（かんじょういん）といったがして開き、後に[[仏教]]の[[三宝]]にちなんで現在の名に改めた。[[康治]]2年（1143年）に[[鳥羽天皇|鳥羽上皇]]の[[御願寺]]となっている。
[[鎌倉時代|鎌倉]]から[[南北朝時代 (日本)|南北朝時代]]にかけて、[[成賢]]（7世）・[[憲深]]（11世）・[[賢俊]]（21世）と高僧を輩出し、[[足利尊氏]]から厚く保護された。特に25世[[足利義満済]]のは「[[猶子黒衣の宰相]]」となった25世[[満済]]はも呼ばれ、[[応永]]3年（[[1396年]]）に[[足利義満]]の[[猶子]]となって醍醐寺座主に任じられ、続いて[[准三后]]となり、後には[[足利義教]]の[[室町幕府]][[征夷大将軍|将軍]]擁立にも活躍するなどしたため、「[[黒衣の宰相]]」と呼ばれた。以後、歴代院主が醍醐寺座主を兼ねる慣例が成立する。また、古くから醍醐寺は[[真言宗]]系の修験の中心であったが、この頃から三宝院が真言宗系の修験者・[[山伏]]の取締にあたるようになる。
ところが、[[応仁の乱]]で三宝院が焼失してしまい、廃寺同然となるが、[[安土桃山時代]]に醍醐寺金剛輪院の院主であった[[義演]]がは[[豊臣秀吉]]の信頼が厚くかったため、金剛輪同院を中心に有名な「[[醍醐の花見]]」が開かれた。義演は准三后となり、秀吉の許可を得て三宝院32世を名乗り、金剛輪院を三宝院と改称した。桜で有名な[[醍醐寺三宝院庭園]]はその時期に整備された。義演は[[徳川家康]]からも信任を受け、[[江戸時代]]初期の[[天台宗]]系修験道である[[本山派]]本山の[[聖護院]]との相論では[[江戸幕府]]の支援を受けて、[[慶長]]18年（1613年）に[[修験道法度]]が制定された。
[[明治]]4年（1871年）、[[廃仏毀釈]]の影響で[[門跡]]号を差し止められるが、14年後に復称する。現在では、真言宗醍醐派総本山としての醍醐寺の宗務事務所が三宝院内に設置され、醍醐派管長・醍醐寺座主・三宝院門跡の三職を兼務する事が定められている。現在はおり、[[仲田順和]]が在任している。
== 伽藍 ==
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