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稲作の起源は2012年現在、考古学的な調査と野生稲の約350系統のDNA解析の結果、約1万年前の[[中国]][[長江]]流域の[[湖南省]]周辺地域と考えられている<ref name="nig1110">A map of rice genome variation reveals the origin of cultivated rice.
Xuehui Huang, Nori Kurata, Xinghua Wei, Zi-Xuan Wang, Ahong Wang, Qiang Zhao, Yan Zhao, Kunyan Liu, Hengyun Lu, Wenjun Li, Yunli Guo, Yiqi Lu, Congcong Zhou, Danlin Fan, Qijun Weng, Chuanrang Zhu, Tao Huang, Lei Zhang, Yongchun Wang, Lei Feng, Hiroyasu Furuumi, Takahiko Kubo, Toshie Miyabayashi, Xiaoping Yuan, Qun Xu, Guojun Dong, Qilin Zhan, Canyang Li, Asao Fujiyama, Atsushi Toyoda, Tingting Lu, Qi Feng, Qian Qian, Jiayang Li, Bin Han
Nature, 490, 497-501 (2012)</ref>。(かつては[[雲南省]]の[[遺跡]]から発掘された4400年前の試料や遺伝情報の多様性といった状況から雲南省周辺から[[インド]][[アッサム州]]周辺にかけての地域が発祥地とされていた<ref name="nig1110"/><ref>池橋宏:イネはどこから来たか―水田稲作の起源― 熱帯農業 Vol.47 (2003) No.5 P322-338 {{doi|10.11248/jsta1957.47.322}}</ref><ref>インドマニプール州の在来イネ品種における遺伝的多様性と亜種分化 Breeding science 46(2), 159-166, 1996-06, {{NAID|110001815365}}</ref>。)
Nature, 490, 497-501 (2012)</ref>。
 
中国では紀元前6000年から紀元前3000年までの栽培痕跡は黄河流域を北限とした地域に限られている。紀元前3000年以降山東半島先端部や遼東半島にまで分布した。<!--最古の水稲の痕跡とされる前七世紀の欣岩里遺跡のイネは陸稲であろう。前六世紀とされる検丹里遺跡の水田跡も水田や環壕まで前六世紀の物と見るのは疑義がある。松菊里遺跡を水稲耕作開始期の遺跡と見るべきではないか。『稲作の起源』355-366頁、池橋宏、 紀元前2000年代には朝鮮半島まで拡大した<ref>甲元眞之、「東アジアの先史農耕」青驪 No.5 2008-2-29 p.30-33, {{hdl|2298/22921}}</ref>。-->