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微生物学とは微生物を対象とする分野。微生物とは細菌、古細菌、原生生物、真菌類など、顕微鏡的大きさ以下の生物を指す。ウイルスをその対象に含める場合もある。主に生化学的な解析を行う。現在は地球科学的因子の一つとして微生物を含めた微生物生態学のようなラージスケールでの解析も行っている。