サイクリンK: cyclin K)は、ヒトではCCNK遺伝子にコードされるタンパク質である[5][6][7]

CCNK
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PDBのIDコード一覧

2I53, 4CXA, 4NST, 4UN0, 5EFQ, 5ACB

識別子
記号CCNK, CPR4, Cyclin K, IDDHDF
外部IDOMIM: 603544 MGI: 1276106 HomoloGene: 14748 GeneCards: CCNK
遺伝子の位置 (ヒト)
14番染色体 (ヒト)
染色体14番染色体 (ヒト)[1]
14番染色体 (ヒト)
CCNK遺伝子の位置
CCNK遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点99,481,169 bp[1]
終点99,535,044 bp[1]
遺伝子の位置 (マウス)
12番染色体 (マウス)
染色体12番染色体 (マウス)[2]
12番染色体 (マウス)
CCNK遺伝子の位置
CCNK遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点108,145,838 bp[2]
終点108,169,618 bp[2]
RNA発現パターン
さらなる参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能 血漿タンパク結合
プロテインキナーゼ結合
RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat kinase activity
cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity
cyclin-dependent protein serine/threonine kinase regulator activity
protein serine/threonine kinase activity
cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activator activity
細胞の構成要素 cyclin K-CDK12 complex
細胞核
cyclin K-CDK13 complex
核質
cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex
P-TEFb
生物学的プロセス positive regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity
transcription elongation from RNA polymerase II promoter
regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity
positive regulation of phosphorylation of RNA polymerase II C-terminal domain serine 2 residues
regulation of transcription, DNA-templated
cellular response to DNA damage stimulus
transcription by RNA polymerase II
negative regulation by host of viral genome replication
positive regulation of transcription by RNA polymerase II
細胞分裂
細胞周期
タンパク質リン酸化
transcription, DNA-templated
snRNA transcription by RNA polymerase II
positive regulation of phosphorylation of RNA polymerase II C-terminal domain
regulation of transcription by RNA polymerase II
positive regulation of DNA-templated transcription, elongation
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
ヒトマウス
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq
(mRNA)

NM_001099402
NM_003858

NM_009832

RefSeq
(タンパク質)

NP_001092872

NP_033962

場所
(UCSC)
Chr 14: 99.48 – 99.54 MbChr 14: 108.15 – 108.17 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
閲覧/編集 ヒト閲覧/編集 マウス

機能 編集

CCNK遺伝子にコードされるサイクリンKタンパク質は、サイクリンファミリーに属する。このサイクリンはコンフォメーション変化によってサイクリン依存性キナーゼ(CDK)への結合と活性化を行い、転写を調節する[8][9]。サイクリンはCDKに結合して活性化し、標的タンパク質をリン酸化によって活性化するキナーゼ複合体が形成される。その後、標的とされたタンパク質は細胞周期の進行に関する決定を調節する。サイクリンKは、CDKとRNAポリメラーゼIIの双方の活性を調節する二重の役割を果たしている[7]。サイクリンKはRNAへの結合を介した機構で転写活性化を行う[10]

相互作用 編集

サイクリンKはCDK9CDK12英語版CDK13英語版を含む複数のCDKと相互作用することが示されており[6][9]、RNAポリメラーゼIIのC末端ドメインのリン酸化の補助などの役割が知られている[11]。サイクリンKは転写伸長のプロセシビティの誘導との関係が最もよく知られている[8]。また、G1S期におけるサイクリン活性も同定されているが、こうした機能の十分な理解は得られていない[5][12]

サイクリンKはHIVNef英語版タンパク質とも相互作用する[13]。Nefタンパク質の過剰発現下ではサイクリンKとCDK9の結合が誘導され、他のCDK9結合複合体による正の伸長因子活性が阻害される。その結果、特定のHIV-1遺伝子の発現が阻害される[9][13]。CDK13はHIV mRNAのスプライシング機構と相互作用し、GagやEnv関連タンパク質の発現を低下させる[10][12]

サイクリンKは白血病細胞の成長に必要不可欠である。SETD1A英語版はFLOSドメインを介してサイクリンKに結合することが知られており[14]、この相互作用はDNA損傷応答遺伝子の発現と白血病細胞の増殖に重要であることが示されている[10][14]

出典 編集

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000090061 - Ensembl, May 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000021258 - Ensembl, May 2017
  3. ^ Human PubMed Reference:
  4. ^ Mouse PubMed Reference:
  5. ^ a b “Human cyclin K, a novel RNA polymerase II-associated cyclin possessing both carboxy-terminal domain kinase and Cdk-activating kinase activity”. Molecular and Cellular Biology 18 (7): 4291–300. (July 1998). doi:10.1128/MCB.18.7.4291. PMC 109013. PMID 9632813. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC109013/. 
  6. ^ a b “Cyclin K functions as a CDK9 regulatory subunit and participates in RNA polymerase II transcription”. The Journal of Biological Chemistry 274 (49): 34527–30. (December 1999). doi:10.1074/jbc.274.49.34527. PMID 10574912. 
  7. ^ a b Entrez Gene: CCNK cyclin K”. 2023年9月16日閲覧。
  8. ^ a b “Crystal structure of human cyclin K, a positive regulator of cyclin-dependent kinase 9”. Journal of Molecular Biology 366 (2): 563–73. (February 2007). doi:10.1016/j.jmb.2006.11.057. PMC 1852425. PMID 17169370. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1852425/. 
  9. ^ a b c “Structural and Functional Analysis of the Cdk13/Cyclin K Complex”. Cell Reports 14 (2): 320–31. (January 2016). doi:10.1016/j.celrep.2015.12.025. PMID 26748711. 
  10. ^ a b c “Cyclin K goes with Cdk12 and Cdk13”. Cell Division 7: 12. (April 2012). doi:10.1186/1747-1028-7-12. PMC 3348076. PMID 22512864. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3348076/. 
  11. ^ “Human cyclin K, a novel RNA polymerase II-associated cyclin possessing both carboxy-terminal domain kinase and Cdk-activating kinase activity”. Molecular and Cellular Biology 18 (7): 4291–300. (July 1998). doi:10.1128/mcb.18.7.4291. PMC 109013. PMID 9632813. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC109013/. 
  12. ^ a b “CDK13, a new potential human immunodeficiency virus type 1 inhibitory factor regulating viral mRNA splicing”. Journal of Virology 82 (14): 7155–66. (July 2008). doi:10.1128/JVI.02543-07. PMC 2446983. PMID 18480452. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2446983/. 
  13. ^ a b “Cyclin K inhibits HIV-1 gene expression and replication by interfering with cyclin-dependent kinase 9 (CDK9)-cyclin T1 interaction in Nef-dependent manner”. The Journal of Biological Chemistry 286 (26): 22943–54. (July 2011). doi:10.1074/jbc.M110.201194. PMC 3123062. PMID 21555514. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3123062/. 
  14. ^ a b “A Non-catalytic Function of SETD1A Regulates Cyclin K and the DNA Damage Response”. Cell 172 (5): 1007–1021.e17. (February 2018). doi:10.1016/j.cell.2018.01.032. PMC 6052445. PMID 29474905. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6052445/. 

関連文献 編集

外部リンク 編集