ラクトバシラス目

ラクトバシラス目(Lactobacillales)とは、乳酸菌を主とした菌を含むフィルミクテス門の細菌の目の一つである。自然界で生成され、土や水、動植物にも存在する。ヨーグルトやチーズ、バター、バターミルクのような乳酸菌を含む醗酵食品にも広く使用されている。

ラクトバシラス目
上皮細胞とその近くにいるラクトバシラス属細菌
分類
ドメイン : 細菌 Bacteria 門 : フィルミクテス門 Firmicutes 綱 : バシラス綱 Bacilli 目 : ラクトバシラス目 Lactobacillales
科
アエロコックス科 Aerococcaceae カルノバクテリウム科 Carnobacteriaceae エンテロコッカス科 Enterococcaceae ラクトバシラス科 Lactobacillaceae ロイコノストック科 Leucinostocaceae レンサ球菌科 Streptococcaceae

乳酸菌としての分類の歴史

乳酸菌の分類体系は、1900年代にグラム陽性、乳酸発酵（ホモ発酵またはヘテロ発酵）によりラクトバシラス属、ペディオコッカス属、ストレプトコッカス属、ロイコノストック属の4属とされた。これに形状（桿菌及び球菌）、カタラーゼ陰性が条件に加えられた。1980年台には細胞壁ペプチドグリカン組成、菌体脂肪酸組成によりストレプトコッカス属からラクトコッカス属とエンテロコッカス属が独立し、ラクトバシラス属からカルノバクテリウム属が独立した。同時期にDNAのGC含量が利用されるようになり、乳酸菌はグラム陽性の低GC含量群に含められた。1990年代、16S rRNA系統解析が導入された結果、乳酸菌のほとんどがラクトバシラス目に含まれることとなった。Bergey's Manual of Systematic Bacteriology 第2版により、ラクトバシラス目は、アエロコックス科、カルノバクテリウム科、エンテロコッカス科、ラクトバシラス科、ロイコノストック科、レンサ球菌科（ストレプトコッカス科）の6科に分類された。

系統樹

現在受け入れられている分類法は、List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclatureの原核生物名リストに基づいており 、系統分類は、'The All-Species Living Tree' Projectの16S rRNA系統解析のLTPリリース106に基づいている。

ラクトバシラス目

Aerosphaera taetra ♠ Hutson & Collins 2000     Carnococcus allantoicus ♠ Tanner et al. 1995     Aerococcaceae       Granulicatella Collins and Lawson 2000         Atopobacter phocae Lawson et al. 2000     Bavariicoccus seileri Schmidt et al. 2009         Trichococcus Scheff et al. 1984 emend. Liu et al. 2002         Lactobacillus algidus Kato et al. 2000       Lactobacillus species group 2       Lactobacillus Beijerinck 1901 emend. Cai et al. 2012       Leuconostocaceae       Lactobacillus species group 3       Lactobacillus species group 4       Lactobacillus species group 5       Lactobacillus species group 6       Pediococcus Claussen 1903     Lactobacillus species group 7                         Carnobacterium Collins et al. 1987       Isobaculum melis Collins et al. 2002       Carnobacteriaceae 2 [incl. various Carnobacterium sp.]       Desemzia incerta (Steinhaus 1941) Stackebrandt et al. 1999   Enterococcaceae & Streptococcaceae (続く)

Lactobacillales part 2 (続き)

Lactobacillales part 2

Vagococcus fessus Hoyles et al. 2000       Vagococcus Collins et al. 1990       Catellicoccus marimammalium Lawson et al. 2006       Enterococcus (ex Thiercelin and Jouhaud 1903) Schleifer and Kilpper-Bälz 1984       Enterococcus phoeniculicola Law-Brown and Meyers 2003       Enterococcus species group 2 [incl. Melissococcus plutonius & Tetragenococcus]       Enterococcus species group 3       Enterococcus species group 4       Enterococcus raffinosus Collins et al. 1989     Enterococcus avium (ex Nowlan and Deibel 1967) Collins et al. 1984       Enterococcus pallens Tyrrell et al. 2002       Enterococcus hermanniensis Koort et al. 2004       Pilibacter termitis Higashiguchi et al. 2006     Streptococcaceae